Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
Lühikesed kordusjärjestused (Short Tandem Repeats - STR)
Proovides varieerub korduste arv (korduspiirkond), kordustega külgnev ala (PCR
praimerite seondumise ala) on konstantne
Homosügoot = mõlemad alleelid on sama pikkusega
14
Heterosügoot = alleelid erineva pikkusega
STR korduste tüübid:
Microsatellite = simple sequence repeat (SSR) = short tandem repeat (STR)
-Dinukleotiid-(CA)(CA)(CA)(CA)
-Trinukleotiid-(GCC)(GCC)(GCC)
-Tetranukleotiid-(AATG)(AATG)(AATG)
-Pentanukleotiid-(AGAAA)(AGAAA)
-Heksanukleotiid-(AGTACA)(AGTACA)
Alleelide kindlakstegemiseks vajalik suurusel põhinev DNA lahutamine;
dinukleotiidsete korduse korral vaja paremat resolutsiooni.
4.Mikrovariantsed STR alleelid (definitsioon, tähistamine) ja null-alleelid (esinemine,
miks probleemsed).
STR markerite bioloogilised "artefaktid":
-"Stutter" produktid
-Matriitsist sõltumatu nukleotiidi lisamine
-Mikrovariandid
-Null-alleelid
-Mutatsioonid
annaabi.ee 
