"a2451" - 1 õppematerjal

“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid

Aga G ei annaks vajaliku H-sidet RF1 jäägiga T186. Seega sobib ainult A. RF2. Pürimidiinid ei annaa vesinuk sidemeid. Seega Avõi U. RF1pos3 Avõi U, RF2- C ja U ei anna hüdroboobseid sidemed. Peptidüül-tRNA estersideme hüdrolüüsiks vajalik GGQ (glütsiin, glütsiin, glutamiin) motiiv RF1/2 domeenis 3. Hüdrolüüs : ester + H2O. Seondumistasku H2O molekulile ▫ Q240 (RF) ▫ C2063 (23S rRNA) ▫ A2451 (23S rRNA) ▫ A76 2’-OH (pept-tRNA) GGQ stabiliseerib vaheoleku.  Mis on ”tripeptiidne antikoodon” RF1 on neli domeeni: Domäänis 2 on tripeptiidne antikoodon, mis tunneb ära terminatsioonikoodoni A-saidis NB! Vaadake loengu “Terminatsioon ja retsükleerumine” slaidi 23  Klass II vabanemisfaktor RF3  Prokarüootides : RF3. Eukarüootides : eRF3. GTPaas : sarnane IF2, EF-Tu ja EF-G-ga. Kolm domeeni : G(incl. G’), II ja III