"6xdna" - 1 õppematerjal

Molekulaar- ja rakubioloogia

asetsetus horisontaalselt), tegime augu hammastega ning panime üleöö tarduma. 3.1 Praktikum – DNA lahutamine geelis Visualiseerime ona PCRi produkti selleks, et kontrollida, kas reaktsioon toimus nii, kui oli oodetud (mitte inhibeeritud, kas kõik komponendid oli lisatud õigesti, kas programm oli koostatud ilma veata jne). Selleks lisasime PCR segule 4 µl 6xDNA värvi, et DNA ilusti hambasse vajuks ja tema migreerumisteekond oleks nähtav. Kandsin kogu segu TAE geelile ja jäätsime geelis lahutama 15min jooksul konstantse pinge all (100V). DNA lahutamine toimub geelis tänu tema fosfaat-selgroo negatiivsele laengule – kui rakendada elekrtiväli, DNA fragmentid hakkavad liikuma katoodile. Mida väiksem on DNA jupp, seda kiiremini ta liigub geelis, sellega väiksemad jupid elektoforeesi lõpus asuvad geeli põhjas (katoodi lähemale) ka