Bioinformaatika ülesanded
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Lokaalse joondamise puhul on järjestuste identsus kõrgem kui globaalse joondamise puhul.
Paistab, et DotPlot näitab natuke rohkem mittevastavusi kui EMBOSS.
2. punkti neljanda järjestuste paari lokaalne joondamine:
########################################
# Program: water
# Rundate: Wed Mar 07 18:24:46 2007
# Align_format: srspair
# Report_file: /ebi/extserv/old-work/water-20070307-18244545482145.output
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: EMBOSS_001
# 2: EMBOSS_001
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 788
# Identity: 507/788 (64.3%)
# Similarity: 507/788 (64.3%)
# Gaps: 262/788 (33.2%)
# Score: 2157.0
#
#
#=======================================
EMBOSS_001 1 atgttgatgattaaaggaattatttttgatatggacggtgttttatttga 50
|||||||||
annaabi.ee 
