Bioinformaatika ülesanded
tehtud tööd.
Vastus:
Kuna nii globaalse kui lokaalse joondamise puhul olid teised parameetrid samad, siis
EMBOSSiga saadud globaalse joondamise ja lokaalse joondamise tulemused on suhteliselt
sarnased.
2. punkti esimese järjestuste paari lokaalne joondamine:
########################################
# Program: water
# Rundate: Wed Mar 07 18:16:26 2007
# Align_format: srspair
# Report_file: /ebi/extserv/old-work/water-20070307-18162542106346.output
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: EMBOSS_001
# 2: EMBOSS_001
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 405
# Identity: 405/405 (100.0%)
# Similarity: 405/405 (100.0%)
# Gaps: 0/405 ( 0.0%)
# Score: 2025.0
#
#
#=======================================
EMBOSS_001 253 tatcaaaaactgttgattacagaagtgaactcttgtcttgaacagttgaa 302