Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
which decrease the number of Gaps introduced.
3. Tundmatu vigase genoomse DNA järjestuse identifitseerimine BLAST-i abil,
vajadusel varieerides parameetreid.
a. Identifitseerida järjestus otsinguga nukleotiidide andmebaasist.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?
cmd=Retrieve&db=Nucleotide&list_uids=169887498&dopt=GenBank&WebEnv=08J
vAS8kBlinjBrUEMjwnEGJY7QsTje9ctJtS_O29kHa_vVcySL_SQi5eaFRYLaT9Shy2
Dl4R1IHFhx%40D45A42847E9DBF30_0786SID&WebEnvRq=1
b.Identifitseerida valgud kasutades DNA transleerimist kõigis 6-s raamis ning otsingut
valkude andmebaasist.
pdb|2J0X|B Chain B, Crystal Structure Of E. Coli Aspartokinase Iii In
Complex
With Lysine And Aspartate (T-State)
Length=446
Score = 268 bits (685), Expect = 7e-70
Identities = 179/184 (97%), Positives = 182/184 (98%), Gaps = 1/184 (0%)
Frame = -3
Query 1339 SAGITNLLVALAEGLEPGERFEKLDAIRNIQFAILERLRYPNVireeierllENItvlae
1160
annaabi.ee 
