Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
220 230 240 250 260 270
Sequen VPTPNVSVVDLTVRLEKAATYEQIKAAVKAAAEGEMKGVLGYTEDDVVSTDFNGEVCTSV
:::::::::::::::::::::::::::
UNIPRO -------VVDLTVRLEKAATYEQIKAAVKAAAEG
200 210 220
280 290
Sequen FDAKAGIALNDNFVKLVSWYDNETGYSN
c. Millised mutatsioonid on tõenäoliselt toimunud valgus?
Eelnevalt jooniselt on näha, et kohtades kus on kriips, siis on toimunud uniproga
võrreldes deletsioon või insertsioon. Mõnes kohas on näha ka punktmutatsioon, siis on
eelneval joonisel kahe punkti asemel üks punkt ahelate vahel.
d. Võrrelda erinevate programmide tulemusi lähtudes kasutatud parameetritest,
kirjeldada lühidalt programmide erinevusi algoritmide seisukohalt. Milline oli
sobivaim?
FASTA: http://www.ebi.uniprot.org/entry/G3P1_SHIFL
Identity: 82.282 %
Similar: 82.282 %
E: 2.2e-40