"triosephosphate" - 1 õppematerjal

Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).

T: 11 A: 40 X1: 16 (7.4 bits) X2: 38 (14.6 bits) X3: 64 (24.7 bits) S1: 41 (20.4 bits) S2: 79 (35.0 bits) b. Uurida leitud oletatavaid konserveerunud domeene, millistes vahemikes asetsevad? Mis piirkond on märgitud umbes 500 aminohappe juures? Millised on tõenäoliselt uuritavad valgud ja miks? VASTUS: Konserveerunud domeenid 500 aminohape juures on valgu piirkond mis, ei sarnane mitte ühtegi valguga. Uuritavad valgud on TIM, Triosephosphate isomerase, CDP-diacylglycerol pyrophosphatase, TpiA, Triosephosphate isomerase, selle pärast, et nendel on kõige suurem skoor.  c. Kirjeldada lühidalt leitud valkude funktsioone (NCBI lingid, võib otsida infot ka teistest andmebaasidest), milline neist on seotud glükolüüsiga? VASTUS: Leitud valkude kirjeldused (lingid): pfam00121, TIM, Triosephosphate isomerase http://www.sanger.ac.uk/cgi-bin/Pfam/getacc?PF00121