Rakutuum
võib nii isa- kui ka emasorganismilt pärit kromosoom ja osades embrüo rakkudes on aktiivne
isalt pärit X kromosoom, osades rakkudes emasorganismilt päritud X kromosoom. Seetõttu on
ka täiskasvanud looma erinevad rakud sellise tunnuse suhtes, mille geen(id) esinevad X
kromosoomis, erinevad. Rakud on mosaiiksed.
X inaktivatsioon toimub teatud geeni (XIST) transkribeerumisel selles kromosoomis. Suur
RNA molekul ei transleeru valguks, jääb tuuma ja seostub kromosoomi DNA-ga ja takistab
transkriptsiooni tekitades heterokromatiini struktuuri. Heterokromatiini struktuuri
formeerumises on osalised ka muutused histoonides (hüpoatsetülatsioon).
X-inaktivatsioon võib mõjutada fenotüüpilisi tunnuseid. Sellest sõltub näiteks nn calico
kasside värvuse muster. Calico kassid (ainult emased) on kolmevärvilised must, valge,
oranzh. Oranzh laik tekib piirkonnas, kus on aktiivne X kromosoom oranzhi alleeliga. Must
annaabi.ee 
