,,allapoole" (ingl. keelest upstream ja downstream), mis tähendab, et need regioonid paiknevad käsiteldavast alast vastavalt kas kodeeriva DNA ahela (transkriptsioonil matriitsahelana toimiva DNA ahela vastasahel) 5´ või 3´ otsa suunas. Niisugune tähistus tuleneb sellest, et RNA süntees toimub alati 5´ 3´ suunas. RNA sünteesi toimumiskohas on DNA ahelad RNA polümeraasi toimel teineteisest eraldunud. Vastavat struktuuri nimetatakse transkriptsioonimulliks. Transkriptsioon prokarüootses rakus Bakterirakus sisaldavad enamus transkripte mitme erineva geeni järjestust. Geenid, mida transkribeeritakse korraga, kuuluvad ühte operoni (operoni kuuluvad ka nende geenide transkriptsiooni reguleerivad DNA järjestused) ja operonilt sünteesitud RNA molekuli nimetatakse polütsistroonseks RNA-ks. Transkriptsioonil eristatakse kolme erinevat staadiumi initsiatsioon, elongatsioon ja terminatsioon.
,,allapoole" (ingl. keelest upstream ja downstream), mis tähendab, et need regioonid paiknevad käsiteldavast alast vastavalt kas kodeeriva DNA ahela (transkriptsioonil matriitsahelana toimiva DNA ahela vastasahel) 5´ või 3´ otsa suunas. Niisugune tähistus tuleneb sellest, et RNA süntees toimub alati 5´ 3´ suunas. RNA sünteesi toimumiskohas on DNA ahelad RNA polümeraasi toimel teineteisest eraldunud. Vastavat struktuuri nimetatakse transkriptsioonimulliks. Transkriptsioon prokarüootses rakus Bakterirakus sisaldavad enamus transkripte mitme erineva geeni järjestust. Geenid, mida transkribeeritakse korraga, kuuluvad ühte operoni (operoni kuuluvad ka nende geenide transkriptsiooni reguleerivad DNA järjestused) ja operonilt sünteesitud RNA molekuli nimetatakse polütsistroonseks RNA-ks. Transkriptsioonil eristatakse kolme erinevat staadiumi initsiatsioon, elongatsioon ja terminatsioon.