Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
järgmistel parameetrite kombinatsioonidel:
>gi|21325986|gb|AAM47554.1|AF428108_1 alpha-enolase [Crocodylus palustris]
MSVLKVHAREIFDSRGNPTVEVDLYTNKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRFMGKGVSKAVEHVN
KTIAPALISKNINVVEQEKIDRLMLEMDGSENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAEKGVPLYRHIADLAGN
SEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDE
GGFAPNILENKEALELLKNAINKAGYSDKIVIGMDVAASEFYRDGKYDLDFKSPDDPSRYITHDQLGDLY
KSFVKNYPVVSIEDPFDQDDWAAWKKFTACVDIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVDEKACNCLLLKVNQIGSV
TESLQACKLAQSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSK
ARFAGRNFRNPRIN
1. default sõna pikkus, skoorimaatriks, tühiku trahv.
2. sõna = 3, PAM30, gap 9/1
Database: All non-redundant GenBank CDS translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF
excluding
environmental samples from WGS projects
Posted date: Apr 1, 2008 5:55 PM
Number of letters in database: -2,114,121,490
Number of sequences in database: 6,388,671
Lambda K H
0.340 0.284 1.71
Gapped
Lambda K H
0.294 0
annaabi.ee 
