"standardparameetrite" - 1 õppematerjal

Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).

4 võib oletada, et antud valgu järjestus omab antud organismi jaoks ka bioloogilist funktsiooni, kuna e väärtus on piisavalt väike ning kokkulangevus ei olnud juhuslik. Järgnevad kaks tulemust arvatavasti ei oma antud organismide jaoks bioloogilist funktsiooni, kuna e-väärtused on juba liiga suured ning kokkulangevus oli juhuslik. phosphopyruvate hydratase E=3.6 Score=32.5 2-phospho-D-glycerate hydrolase [Nereis macrydi] E=6.5 Score=31.6 c. Võrdle antud programmi standardparameetrite (filtrid, expect, sõna pikkus, maatriksi tüüp, tühiku skoorid) väärtuseid eelmises ülesandes kasutatud programmi standardparameetrite väärtustega. Kasutades juhendeid, tutoriale, abidokumente jne, selgitada nende väärtuste erinevuste põhjused ­ miks on teatud väärtused sobivad täieliku pikkusega valgujärjestuste jaoks ja miks teatud väärtused motiivide otsingutel.