Rakutuum
terminal repeats, LTR). Seega retroviirused võiksid olla transposoonid, mis on omandanud
viiruste kesta valku kodeerivad geenid (või vastupidi). Mitteviiruslikud
retrotransposoonid on varieeruva pikkusega, LTR puuduvad, täispikk koopia sisaldab
pöördtranskriptaasi geeni. Näiteks maisi retrotransposoon Mu (mutator) paljuneb nii
kiiresti, et genoom muteerub ~50 korda sagedamini kui ilma selle retrotransposoonita
genoom. Kõik seni uuritud eukarüoodid sisaldavad retrotransposone. Imetajates peamiselt
mitteviiruslikud, pärmides ja Drosophila peamiselt viiruslikud.
~45% inimese genoomist koosneb retrotransposoonidest. Esineb ~60000 koopiat LINE (ingl
long interspersed nuclear element) tüüpi L1, moodustab ~15% genoomist. LINE-d on pikad
(~5000bp) DNA järjestused mis kujutavad endast RNA polümeraas II poolt tekkinud mRNA
pöördtranskribeeritud molekule