Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
b. Milline on uuritav valk, millised ortoloogid ja paraloogid leiti erinevatel
otsingutel?
. ortoloog eri liikidest pärit järjestused, millel on üks ühine eellane
4
paraloog samast liigist pärit järjestused, millel on üks ühine eellane
Uuritav valk: Glyceraldehyde 3-phosphate
E. Colide puhul esineb nii ortolooge kui paralooge.
Näiteks paraloogid:
>>UNIPROT:Q6WAN9_ECOLX Q6WAN9 Glyceraldehyde phosphate d (220 aa)
initn: 1051 init1: 715 opt: 721 Z-score: 859.5 bits: 166.6 E(): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 1058; 75.8% identity (75.8% similar) in 244 aa
overlap (36-244:1-220)
10 20 30 40 50 60
Sequen VFRAAQKRSDIEIVAINDLLDADYMAYMLKYDSTHGRFDGTVEVKDGHLIVNGKKIRVTA
::::::::::::::::::::::::::::::
UNIPRO YDSTHGRFDGTVEVKDGHLIVNGKKIRVTA
annaabi.ee 
