"pfam" - 1 õppematerjal

Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).

Uuritavad valgud on TIM, Triosephosphate isomerase, CDP-diacylglycerol pyrophosphatase, TpiA, Triosephosphate isomerase, selle pärast, et nendel on kõige suurem skoor.  c. Kirjeldada lühidalt leitud valkude funktsioone (NCBI lingid, võib otsida infot ka teistest andmebaasidest), milline neist on seotud glükolüüsiga? VASTUS: Leitud valkude kirjeldused (lingid): pfam00121, TIM, Triosephosphate isomerase http://www.sanger.ac.uk/cgi-bin/Pfam/getacc?PF00121 COG0149, TpiA, Triosephosphate isomerase [Carbohydrate transport and metabolism] http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi? db=Pubmed&term=6759603,2204418,9133595,1588965,7217001,2263469 pfam02611, CDH, CDP-diacylglycerol pyrophosphatase http://www.sanger.ac.uk/cgi-bin/Pfam/getacc?PF02611 COG3152, COG3152, Predicted membrane protein [Function unknown] http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?