Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
nucleotides or amino acid is also penalized in the scoring of an alignment.
d. Varieerida parameetreid ükshaaval, selgitada nende mõju tulemustele:
Mõju avaldas parameetrite muutmine vaid skoorile, expect ei muutunud.
i. Leida skoor ja E järjestuse gi|21325986|gb|AAM47554.1| jaoks
järgmistel parameetrite kombinatsioonidel:
>gi|21325986|gb|AAM47554.1|AF428108_1 alpha-enolase [Crocodylus palustris]
MSVLKVHAREIFDSRGNPTVEVDLYTNKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRFMGKGVSKAVEHVN
KTIAPALISKNINVVEQEKIDRLMLEMDGSENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAEKGVPLYRHIADLAGN
SEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDE
GGFAPNILENKEALELLKNAINKAGYSDKIVIGMDVAASEFYRDGKYDLDFKSPDDPSRYITHDQLGDLY
KSFVKNYPVVSIEDPFDQDDWAAWKKFTACVDIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVDEKACNCLLLKVNQIGSV
TESLQACKLAQSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSK
ARFAGRNFRNPRIN
1. default sõna pikkus, skoorimaatriks, tühiku trahv.
2
annaabi.ee 
