Eukarüoodid
Vanimad eukarüootide kivistised on 1,5
(võibolla isegi 1,7-1,9) miljardit aastat vanad, kuid neid ei ole võimalik kindlalt paigutada
ühessegi tänapäeval elavasse rühma (Javaux et al., 2003; Katz et al., 2004).
Eukarüootide evolutsioonis on olulist rolli mänginud endosümbioos. Kahte tüüpi organellid
plastiidid (kloroplastid) ja mitokondrid pärinevad kunagi eukarüoodi poolt fagotsütoosi teel
omandatud bakteritest. Mitokonder pärineb -proteobakterist ning algselt ilma mitokondrita
eukarüoote pole suure tõenäosusega olemas. Kõikidel amitokondriaalsetel (mitokondrita)
eukarüootidel on kindlaks tehtud, et neil kas on kunagi olnud mitokonder (tõenduseks on
tüüpiliste mitokondri geenide esinemine rakutuumas) või on see tugevalt redutseerunud e.
taandarenenud (näiteks hüdrogenosoomideks, mitosoomideks). Kloroplastide evolutsioon on
pisut keerulisem. Primaarne endosümbioos (eukarüoot neelab tsüanobakteri, kellest kujuneb