Konspekt aastast 2005
molekulaarsed meetodid vib laias laastus
jagada kaheks: osaliseks ja tielikuks koosluse
DNA analsiks (partial and whole community
DNA analysis). Osalise analsi puhul
keskendutakse vaid osale genoomist,
markergeenidele, mis amplifitseeritakse PCR-i
meetodi abil. Tieliku koosluse analsi puhul
ptakse uurida kogu informatsiooni, mida
eraldatud DNA sisaldab.
Probleemid molekulaarsete meetodite
kasutamisel: DNA-l phinevad meetodid sltuvad DNA eraldamise kvaliteedist.
Erinevad bakterid lsuvad
erinevalt, seega on vimalik et osa bakterirakke ei lsu ldse, seega jb
osa bakterite DNA-st keskkonnast
eraldamata. Praimerite jrjestused, mida kasutatakse
polmeraasahelreaktsioonis, on koostatud publitseeritud
jrjestuste phjal, mis ei pruugi adekvaatselt kajastada mittekultiveeritavate
bakterite jrjestusi. Polmeraasi
ahelreaktsiooni kigus vivad tekkida kimeersed produktid.
Mikroobikoloogias kasutatavate molekulaarsete meetodite esmased kasutajad olid
Carl Woese ja Norm Pace.
annaabi.ee 
