Kookosõli meenutav, rasvane (-nonalaktoon) virsikud 4-dekanoliid Puuviljane, virsikud Rasva sisaldav toit (-dekalaktoon) 5-dekanoliid Õline, virsikud Rasva sisaldav toit (-dekalaktoon) (Z)-6-dodetseen--laktoon Magus Piimarasv, virsikud 3-metüül-4-oktanoliid Kooospähkli-sarnane Alkohoolsed joogid (viski- või tammelaktoon) Terpeenid Terpeenide lõhnalävi varieerub laiades piirides. Mõningad terpeenid on maitsetaimedes suurtes koguses iseloomulikud võtmekomponendid Hüdroksü-rühmaga monoterpeenid (nt linalool, geraniool, nerool) on puuviljamahlas glükosiidide koostises.
hape, f) ammoniaak ja 4-halokarbonüülbutaanhape Aluselisel hüdrolüüsil (näiteks reaktsioon NaOH-ga) moodustuvad: a) metanool ja naatriumheksanaat, b) isopropüülamiin ja naatriumpropanaat, c) etanool ja naatrium-2-aminobutanaat, d) butaan-1-ool ja naatriumetanaat, e) metanool ja naatrium- propaan-1,3-diaat, f) ammoniaak ja naatriumpentaan-1,5-diaat. 3. a) tsükliline ester ehk laktoon, hüdrolüüsil moodustub 4-hüdroksübutaanhape; b) eeter, ei hüdrolüüsu; c) tsükliline amiid ehk laktaam, hüdrolüüsil moodustub 5-aminopentaanhape; d) tsükliline aldool, tasakaalulisel reaktsioonil moodustub 4-hüdroksübutanaal; e) eeter, ei hüdrolüüsu; f) eeter ja sekundaarne amiin samaaegselt. 4. Võrdle reaktsioonivõrrandeid: O O
ligandid/modulaatorid, - Looduslike ühendite skriining: ammendamatu allikas. Beyond the wildest wet dreams of an organic chemist. Liigne keerukus, liiga madal sisaldus looduslikes objektides. Tõeline nuss on eraldada neid aineid arvestatavas koguses. - Artemisiniin – tänapäeval üks tugevama mõjuga anti-malaaria ravimeid. Poolsünteetiline. (2015.a Nobeli preemia meditsiinis). Olles sekviterpeen- laktoon ning sisaldades ebaharilikku peroksiid-silda, millest viimane võib osaleda aine toimemehhanismis. WHO ei soovita ained üksinda kasutada, kuna malaaria parasiititel tekib resistentsus. - Taksool – vähiravim; inhibeerib mikrotuubulite lagundamist ja seega rakujagunemist. - Taimed – lõputu ühendirikkus, leidmistõenäosus on suur. Toksilisi ühendeid sisaldavatel taimedel on suurem tõenäosus ellu jääda – loodusepoolne skriining.
CAP). Globaalse regulatsiooni kirjeldamiseks on võetud kasutusele veel mõiste stimulon. Stimuloni kuuluvad geenid, operonid, regulonid ja modulonid, mille tööd mõjutab üks ja sama keskkonnastiimul. Suur osa neist stiimulitest on tunnetatavad rakusiseselt. Samasse stimuloni kuuluvate regulatoorsete üksuste tööd kontrollivad erinevad regulaatorid. Stiimulite mõjul võidakse sünteesida väikeseid signaalmolekule nagu näiteks cAMP, ppGpp või homoseriin laktoon, mis mõjutavad transkriptsiooni kas otseselt või interakteerudes transkriptsioonifaktoritega. Globaalse regulatoorse võrgustiku uurimine eeldab erinevate meetodite kombineeritud rakendamist: 1. Genoomi järjestuse analüüs võimaldab identifitseerida potentsiaalseid promootoreid ja motiive, mis on konserveerunud sama regulaatori poolt kontrollitavate geenide ees. Regulaatori seondumisala suurem kokkulangevus konsensusjärjestusega esineb geenide puhul, mille
Agrobacterium 3-okso-C8-HSL traI-traR Ti-plasmiidi konjugatsioon tumefaciens Vibrio fischeri 3-okso-C6-HSL luxI-luxR Bioluminestsents Vibrio harveyi 3-hüdrokso-C4-HSL luxLMN- Bioluminestsents luxR Serratia C4-HSL, C6-HSL swrL Voogamine liquefaciens Erwinia 3-okso-C6-HSL, car Ekstratsellulaarsed carotovora laktoon ensüümid (pektaatlüaas, tsellulaas, proteaas) 15.1. Hulgatunnetuse signaalmolekulid ja sensorsüsteemid Signaalmolekule, mis võivad vahendada hulgatunnetust G(-) ja G(+) bakteritel, on väga palju ning nad on jaotatud 4 rühma. Peamised tunnusjooned on toodud allolevas tabelis. 129 Hulgatunnetuse Signaalmolek
lised ja molekulisisesed funktsionaalsete rühmade interakt- Tsitraat sioonid tekitavad tsüklilisi struktuure. Mõned loodusühendid on hüdroksühapete 5-liikmelised tsüklilised laktoonid (nt vitamiin C ehk 2-okso-L-guloonhappe-γ-laktoon, joon 35). Joon. 35 O O Ketohapped HO O Need ühendid sisaldavad karboksüül- ja karbonüülrühma. O O Inimorganismis on nad süsivesikute ja aminohapete meta-
O O OH OH + O O OH O + HO OH HO H HO OH OH Tekib glükonolaktoon (laktoon on siseester), O 2st tekib peroksiid, sest kaksikside läheb katki. Seda ensüümi kasutatakse glükoosi määramise reaktsioonis. Aeroobse kontaminatsiooni vältimiseks pannakse konservide sisse glükoosi oksüdaasi. Konservis ikka glükoosi on, selle oksüdeerudes tarbitakse antud reaktsiooniga konservikarbist O 2 ära ja siis ei saa aeroobsed kontaminaatorid kasvada vms. Suktsinaadi dehüdrogenaas (fumaraadi reduktaas)
Paljusid raku toitumisega seotud stiimuleid tunnetatakse samuti kaudselt, nende mõju kaudu raku metabolismile. Näiteks ammooniumi olemasolu tunnetatakse glutamiini ja -ketoglutaraadi rakusisese kontsentratsiooni kaudu. Enamuse kataboolsete radade puhul kontrollib substraadi või selle laguprodukti olemasolu rakus seda, kas vastava raja geenid avalduvad või mitte. Stiimulite mõjul võidakse sünteesida väikeseid signaalmolekule nagu näiteks cAMP, ppGpp või homoseriin laktoon, mis mõjutavad transkriptsiooni kas otseselt või interakteerudes transkriptsioonifaktoritega. Signaalne transduktsioon Lisaks rakusiseselt tunnetatavatele stiimulitele on neid, mida tunnetatakse rakupinnal. Sel juhul on tegemist väliskeskkonna otsese tunnetamisega spetsiifiliste transmembraansete retseptorite abil, mis kannavad signaali rakku. Vastavat protsessi nimetatakse signaalseks transduktsiooniks. Tavaliselt toimub signaali ülekandumine kahekomponendilise süsteemi abil