"ktiapaliskninvveqekidrlmlemdgsenkskfganailgvslavckagaaekgvplyrhiadlagn" - 1 õppematerjal

Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).

d. Varieerida parameetreid ükshaaval, selgitada nende mõju tulemustele: Mõju avaldas parameetrite muutmine vaid skoorile, expect ei muutunud. i. Leida skoor ja E järjestuse gi|21325986|gb|AAM47554.1| jaoks järgmistel parameetrite kombinatsioonidel: >gi|21325986|gb|AAM47554.1|AF428108_1 alpha-enolase [Crocodylus palustris] MSVLKVHAREIFDSRGNPTVEVDLYTNKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRFMGKGVSKAVEHVN KTIAPALISKNINVVEQEKIDRLMLEMDGSENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAEKGVPLYRHIADLAGN SEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDE GGFAPNILENKEALELLKNAINKAGYSDKIVIGMDVAASEFYRDGKYDLDFKSPDDPSRYITHDQLGDLY KSFVKNYPVVSIEDPFDQDDWAAWKKFTACVDIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVDEKACNCLLLKVNQIGSV TESLQACKLAQSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSK ARFAGRNFRNPRIN 1. default sõna pikkus, skoorimaatriks, tühiku trahv. 2. sõna = 3, PAM30, gap 9/1