Konspekt aastast 2005
Probleemid molekulaarsete meetodite
kasutamisel: DNA-l phinevad meetodid sltuvad DNA eraldamise kvaliteedist.
Erinevad bakterid lsuvad
erinevalt, seega on vimalik et osa bakterirakke ei lsu ldse, seega jb
osa bakterite DNA-st keskkonnast
eraldamata. Praimerite jrjestused, mida kasutatakse
polmeraasahelreaktsioonis, on koostatud publitseeritud
jrjestuste phjal, mis ei pruugi adekvaatselt kajastada mittekultiveeritavate
bakterite jrjestusi. Polmeraasi
ahelreaktsiooni kigus vivad tekkida kimeersed produktid.
Mikroobikoloogias kasutatavate molekulaarsete meetodite esmased kasutajad olid
Carl Woese ja Norm Pace.
Nide: Erinevate koosluste mitmekesisuse
vrdlus
Akumulatsioonikverad
1.Michigani taimed
2.Costa Rica linnud
3.Mikroobikooslus inimese suust
4.Costa Rica liblikad
5.Vihmametsade mulla mikroobikooslus
Kui akumulatsioonikver lheneb platoole (niteks
jooned 1 ja 2), siis on koosluse liigiline
mitmekesisus hsti kirjeldatud st. isegi kui jtkata