valgu konformatsiooni muutmiseks · Erinevaid aminohappelisi järjestusi sisaldavad valgud lagundatakse erinevate proteasoomide poolt. Näiteks Arg-X-X-Leu-Gly-X-Ile-Gly-Asx lagundatakse ubikvitiiniga konjugeeruva valgulise kompleksi E1 abil. Valgud, mis sisaldavad Pro, Glu, Ser, Thr (nn PEST järjestus) lagundatakse teiste komplekside poolt. Proteasoomide tähtsus immuureaktsioonides Organismide rakud nakatuvad sageli viirustega. Kaitsereaktsiooniks on nakatatud rakkude hävitamine immuunsüsteemi tsütotoksiliste T lümfotsüütide (tapjarakud, ingl. killer cells) poolt rakulise immuunsüsteemi vahendusel. Organismide kõik rakud hüdrolüüsivad valke peptiidideni ja eksponeerivad neid peptiide rakkude pinnal. Tapjarakud ei reageeri peptiididele, mis pärinevad normaalsetest rakkudest, kuid reageerivad sellistele rakkudele mis eksponeerivad viirusvalgu tükke. Sellised rakud hävitatakse. T-killerid ei reageeri kui rakkude