Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
YQRS*F*RHEPQR*YCAF*CQRAFSCPL
Sbjct 4330920 YQRS*F*RHEPQR*YCAF*CQRAFSCPL 4330837
Sarnaseid järjestusi leiti veel näiteks organismides:
Shigella
Klebsiella
Enterobacter
Yersinia pseudotuberculosis
b. Analüüsida tulemusi mis liik, mis geenid ja valgud. Milline algoritm oli
kõige tundlikum.
Esimene meetod andis esimese tulemusena E. Coli aspartokinaasi III, teine meetod pakkus
hohkem erinevaid variante, esimene valk oli E. Coli kas aspartokinase III või
glucosephosphate isomerase.
Ccgagaggacaactaaacgcacgttggcatcagaaagcacaatatcagcgctgcggttcatggcgtcaaaatcagctacgctggtac
cgccaaatttggagacaacaatttcagacataactacctcgtgtcaggggatccattttcagccttggcacaagggaagagcggaagac
gggtgggcgcagagcgatacttcgctactattttcacccagaagtgctccaccacttgcgaaacgcccgactgcgaacgcttctggtga
caacccaggggattcagcccctgtagccgatgatgaacgtggccagccgttcaatcacctcggcgatgcaccccctcaggtgttatca