"ggfapnilenkealellknainkagysdkivigmdvaasefyrdgkydldfkspddpsryithdqlgdly" - 1 õppematerjal

Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).

i. Leida skoor ja E järjestuse gi|21325986|gb|AAM47554.1| jaoks järgmistel parameetrite kombinatsioonidel: >gi|21325986|gb|AAM47554.1|AF428108_1 alpha-enolase [Crocodylus palustris] MSVLKVHAREIFDSRGNPTVEVDLYTNKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRFMGKGVSKAVEHVN KTIAPALISKNINVVEQEKIDRLMLEMDGSENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAEKGVPLYRHIADLAGN SEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDE GGFAPNILENKEALELLKNAINKAGYSDKIVIGMDVAASEFYRDGKYDLDFKSPDDPSRYITHDQLGDLY KSFVKNYPVVSIEDPFDQDDWAAWKKFTACVDIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVDEKACNCLLLKVNQIGSV TESLQACKLAQSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILRIEEELGSK ARFAGRNFRNPRIN 1. default sõna pikkus, skoorimaatriks, tühiku trahv. 2. sõna = 3, PAM30, gap 9/1 Database: All non-redundant GenBank CDS translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples from WGS projects  Posted date: Apr 1, 2008 5:55 PM