energeetiline kasum on 2 ATP Anaeroobse glükolüüsi käik 1.Glükoosi fosforüülimine, Glükoos-6-fosfaadi teke (1ATP) 2. Glükoos-6-fosfaat → Fruktoos-6-fosfaat 3. Fruktoos-6-fosfaat → Fruktoos-1,6-bisfosfaat (-1ATP) 4. Fruktoos-1,6-bifosfaat → Dihüdroksüatsetoonfosfaat (DAP) ja Glütseeraldehüüd-3-fosfaat (GAP) 5. DAP↔GAP 6. Glütseeraldehüüd-3-fosfaat (GAP) → 1,3bisfosfoglütseraat (2tk) 7. 1,3-bisfosfoglütseraat → 3-fosfoglütseraat (ADP →ATP) 8. 3-fosfoglütseraat → 2-fosfoglütseraat 9. 2-fosfoglütseraat → Fosfoenoolpüruvaat (PEP) 10. Fosfoenoolpüruvaat (PEP) → Püruvaat (ADP → ATP) 11. Püruvaat → Laktaat Anaeroobsel glükolüüsil vajalikud ensüümid 1. Heksoosi kinaas (Mg2+), Glc – 6 – P pärsib aktiivsust, INS indutseerib ensüümi sünteesi 2. Fosfoglükoosi isomeraas (Mg2+) 3. Fosfofruktoosi kinaas, FFK1 (Mg2+) – allosteeriline ATP/AMP suhtele; AMP ja Fru-2,6-bisP aktiveerivad, tsitraat ja ATP pärsivad 1. Fru-2,6-bisP teket
ensüümidest. · ASENDATAVAD (nn mitte-essentsiaalsed): Ala, Asn, Asp, Cys, Glu, Gln, Gly, Pro, Ser, Tyr AMINOHAPETE BIOSÜNTEESI LÄHTEAINED NB! Enamik organisme (taimed, mikroorganismid) võimelised sünteesima kõiki aminohappeid Sünteesi lähteained Aminohapete arv · -ketohapped -KETOGLUTARAAT 4 OKSALOATSETAAT 6 PÜRUVAAT 3 · 3-fosfoglütseraat 3 · Riboos-5- P 1 · Fosfoenoolpüruvaat + Erütroos- 4- P 3(aromaatsed) NH3 KUI LÄMMASTIKÜHENDITE AINEVAHETUSE LÕPP-PRODUKT · VÄLJUTATAKSE ORGANISMIST · KASUTATAKSE MITTETOKSILISTE ÜHENDITE (NB! Glutamaat) SÜNTEESIKS Lämmastiku ainevahetuse lõpp-produktid kuuluvad inimestel ja teistel imetajatel URIINI koostisse.
10, sest imetajatel puudub vastav ensüüm sünteesimiseks. Kas võite nimetada need aminohapped? Arginiin, histidiin, isoleutsiin, leutsiin, lüsiin, metioniin, fenüülalaniin, treoniin, valiin, trüptofaan. 10. Milliseid aminohapete sünteesi lähteühendeid teate (nimetused ja struktuurid)? 1) alfa-ketohapped O -OO C R - alfa-ketoglutaraat - oksaalatsetaat - püruvaat 2) 3-fosfoglütseraat COO- CH-OH CH2-O-P 3) riboos-5-P 4)fosfoenüülpüruvaat + erütroos-4-P Milliste oluliste ainevahetusradade metaboliitidega on tegemist? TCA tsükli, glükolüüsi. 11. Aminohapete biosünteesil on võtmepositsioonis -ketohapete transamineerimise reaktsioonid. Kirjutage reaktsioon, mis näitab oksaalatsetaadi transamineerimist aspartaadiks Glu KG vahendusel. 12. Mille järgi klassifitseeritakse aminohappeid glükogeenseteks ja ketogeenseteks
aminohappeid.Glükoneogeneesi toimumiseks on vaja kulutada energiat.Protsessi regulatsioon eeldab ühe protsessi sisselülitamist ja teise väljalültamist. Etapid 2 ja 4 on samad,mis glükolüüsilgi.Teised glükolüüsi protsesid on asendatud 4 unikaalse protsessigam tänu millele muudetakse protsess spontaanseks. Glükoneogenees ei ole glükolüüsi pöördprotsess, sest osa reaktsioone on pöördumatud. Aminohapete sünteesi lähteühendid: alfa-ketohapped OO-C(=O)-R (ntks püruvaat),3-fosfoglütseraat OOC(- OH)-Ch2-O-P, riboos-5-P.Puriinide biosüntees algab riboos-5-fosfaadi aktiveerimisega ATP molekulist pärineva PPi abil. Tekkiv 5-fosforibosüülpürofosfaat on aine, mis limiteerib sünteesi, mille juurde astemiliselt spnteesitakse heterotsükliliste ringside struktuurid.Pürimidiinnukleotiidide denovo sünteesi keskseks intermediaadiks , millele liitub PPi on oroothape.Geneetiline kood on nukleiinhappe ahela teatava lõigu nukleotiidide järestuse ja polüpeptiidiahela
ensüümi trioosfosfaadi isomeraasi vahendusel. Nüüd on meil kaks molekuli glütseraldehüüd-3-fosfaati, mistõttu edaspidi tuleb saagis korrutada kahega. VI Toimub GAP aldehüüdrühma oksüdeerimine, mille tulemusel tekib makroergilist sidet omav 1,3-bisfosfoglütseraat. Ensüümiks on glütseraldehüüd-3-fosfaadi dehüdrogenaas. Saagiseks on ka 1 NADH molekul. VII Toimub 1,3-bisfosfaadi makroergilise fosfaatgrupi ülekanne ADP-le, mille tulemusel tekib 3-fosfoglütseraat ja ATP ensüümi fosfoglütseraadi kinaas vahendusel. Reaktsioon on pöörduv. VIII Toimub fosfaatgrupi ülekanne asendist 3 asendisse 2, mille tulemusel tekib 2-fosfoglütseraat ensüümi fosfoglütseraadi mutaas vahendusel. Reaktsioon on pöörduv. IX 2-fosfoglütseraat dehüdrateerub enolaasi vahendusel fosfoenoolpüruvaadiks. Reaktsioon on pöörduv. X Fosfoenoolpüruvaadi energia arvel sünteesitakse püruvaadi kinaasi vahendusel ATP ja püruvaat. Reaktsioon on pöörumatu.
ahelatesse ja siis on see molekul juba tärklise molekul: glükoos … või tselluloosi molekul … või tselluloosi molekul Fotosünteesi erinevusi • Parasvöötme taimedel - õhulõhed öösel kinni… ? • Kõrbetaimedel – õhulõhed öösel lahti…? • Troopikataimed? Uuri C3, C4 ja CAM taimede erinevusi. Lisalugemine C3- taimed on paraskliimavöötme taimed, milles fotosünteesi ajal kõigepealt moodustub kolme süsinikaatomiga 3-fosfoglütseraat, päeval on nende õhulõhed avatud, öösel suletud. C4- taimed on taimed, mis on kohastunud kuumas kliimas, sulgevad õhulõhed, kui on liiga kuum ja ei võta seda fotosünteesiks otse õhust, vahendab RuBisCO. Neid ei kahjusta fotorespiratsioon. C4-taimed on peamiselt kõrbetes ja troopikas. Nad moodustavad umbes 5% taimeliikidest. – mais ja suhkruroog , CAM – kaktused, sukulendid, kukeharjad, ananass – öösel õhulõhed lahti . •Ülesanne
Viimane muundub trioosfosfaadi isomeraasi mõjul samuti glütseeraldehüüd-3-fosfaadiks ning glükolüüsi rada jätkub kahe identse rajana. Siis glütseeraldehüüd-3-fosfaat oksüdeeritakse glütseeraldehüüd-3-fosfaadi dehüdrogenaasi poolt 1,3- bisfosfoglütseraadiks. Selles reaktsioonis osaleb koensüümina NAD+, mis redutseeritakse NADH+H+. Seejärel kantakse 1,3-bisfosfoglütseraadilt fosfoglütseraadi kinaasi toimel üks fosfaatrühm üle ADP-le, mille tulemusena tekib ATP ja 3-fosfoglütseraat. Sellega on reaktsioon energeetiliselt tasakaalustunud (kulutatud on 2 molekuli ATP-d ja sünteesitud samuti 2 molekuli ATP-d). See fosfaatrühm kantakse fosfoglütseraadi kinaasi toimel üle teisele süsinikule, tekib 2-fosfoglütseraat, millest enolaasi toimel saadakse fosfoenoolpüruvaat. Sellest võtab püruvaadi kinaas ära fosfaatrühma, mille ta seob ADP-ga (tekib ATP) ning fosfoenoolpüruvaadist saab lihtsalt püruvaat.
(GAP). Teises faasis tekib kaks molekuli püruvaati. Saadakse netona 4 ATP. Kuuendas reaktsioonis GAP oksüdeeritakse glütseraalaldehüüd-3-fosfaadi dehüdrogenaasi toimel 1,3-difosfoglütseraadiks (1,3-BPG). Seitsmendas reaktsioonis kantakse fosforüülrühm 1,3-GAP'lt üle ADP'le ja saadakse 3-fosfoglütseraat. Kaheksandas reaktsioonis 3-fosfoglütseraat konvergeeritakse fosfoglütseraadi mutaasiga 2-fosfoglütseraadiks. Üheksandas reaktsioonis 2-fosfoglütseraat dehüdraaditakse enolaasiga fosfoenoolpüruvaadiks (PEP). Kümnendas reaktsioonis püruvaadi kinaasiga kantakse fosforüülrühma PEP'lt üle ADP'le ja saadakse 2 püruvaat. ( ) ( ) ( )
NAD+ sõltuvat G3P oksüdatsiooni 1,3-bisfosfoglütseraadiks (1,3BPG), millega kaasneb NADH teke. G3PDH reaktsioon on rakus pöörduv ning vastav ensüüm katalüüsib seega ka glükoneogenesi pöördreaktsiooni. 7. Fosfoglütseraadi kinaas Makroergiline ühend 1,3BPG kasutatakse fosfoglütseraadi kinaasi reaktsioonis ATP saamiseks. Tegemist on substraadi tasemel fosforüülimise reaktsiooniga. Teise produktina moodustub 3-fosfoglütseraat. See on glükolüüsi raja ainuke ATP osalusel toimuv reaktsioon, mis kulgeb rakus pöörduvates tingimustes. Sama ensüüm katalüüsib ka glükoneogeneesi pöördreaktsiooni. Fosfoglütseraadi kinaasi ja 1,3BPG-ga on erütrotsüütides assotseerunud oluline reaktsioon, mida katalüüsib bisfosfoglütseraadi mutaas. Reaktsiooni tulemusel moodustub 2,3-bisfosfoglütseraat (2,3BPG), oluline hemoglobiini ja hapniku vahelise kompleksi moodustamise allosteeriline regulaator
Täpsem nimi on ribuloos-1,5-difosfaadi karboksülaas/oksügenaas. Tõenäoliselt maailma kõige levinum valk. Lokaliseerub kloroplastide stroomas. 6. Calvin-Bensoni tsükli iseloomustus, kesksed metaboliidid, seosed glükolüüsi reaktsiooniahela metaboliitidega, tsükli lõpp-produkt ja selle transformatsioonid. Tegemist on pimereaktsioonidega. Eristatakse nelja etappi: I etapp CO2 sidumine pentoossuhkrust aktseptorile (ribuloos-1,5-disfosfaat) ning trioossuhkru (3- fosfoglütseraat) teke. Osaleb Rubisco ensüüm, mis katalüüsib CO2 liitumist pentoosile. Selle tulemusena tekib vaheühendina heksoos, mis seejärel lõigatakse kaheks trioosiks. II etapp 3-fosfoglütseraadi konversioon glütseeraldehüüd-3-fosfaadiks. III etapp süsivesikute süntees glütseeraldehüüd-3-fosfaadist. IV etapp ribuloos- 1,5-difosfaadi regenereerimine. 1molekuli glükoosi tootmiseks kulub 6 Calvini tsüklit ja 6
4. Kirjeldage reaktsioonid, mille tulemusel toimub glütseeraldehüüd-3-fosfaadi konversioon püruvaadiks. Nimetage vaheühendid, ensüümid, kofaktorid. Nimetage reaktsioonid, kus toimub ATP tootmine. DHAP GAP (trioosfosfaadi isomeraas) reaktsioon kulgeb üle enediooli (vaheühend). GAP + NAD+ + Pi 1,3-bisfosfoglütseraat + NAD3H (glütseeraldehüüd-3-fosfaadi dehüdrogenaas) 1,3-bisfosfoglütseraat + ADP 3-fosfoglütseraat + ATP (fosfoglütseraadi kinaas) 3-fosfoglütseraat 2-fosfoglütseraat 2,3-bisfosfoglütseraat (fosfoglütseraadi mutaas) 2-fosfoglütseraat fosfoenoolpüruvaat (fosfoglütseraadi enolaas) Fosfoenoolpüruvaat (PEP) + ADP enoolpüruvaat püruvaat (püruvaadi kinaas) FRUKTOOS JA GALAKTOOS 1. 2 rada glütseeraldehüüd-3-fosfaadi saamiseks fruktoosist. 2. Glükoos-6-fosfaadi teke galaktoosist. UDP-suhkrud. Galaktoos galaktoos-1-fosfaat (galaktokinaas)
See on energia genereerimise faas: 1 glükoosi molekuli kohta tekib 2 püruvaadi molekuli. Tekib 2 NADH ja 4 ATP molekuli Osaleb 2 makroergilist fosfaati: § 1,3-Difosfoglütseraat § Fosfoenoolpüruvaat Reaktsioon: Ensüüm: 6. Glütseeraldehüüd-3-P1,3-Difosfo- Glütseeraldehüüd-3-P- dehüdrogenaas glütseraat 7. 1,3-Difosfoglütseraat 3-Fosfo- Fosfoglütseraadi kinaas glütseraat 8. 3-Fosfoglütseraat 2-Fosfoglütseraat Fosfoglütseraadi mutaas 9. 2-Fosfoglütseraat Fosfoenoolpüruvaat Enolaas 10. Fosfoenoolpüruvaat Püruvaat Püruvaadi kinaas* NB! ADP fosforüleerimine ATPks toimub substraadi tasemel NADH transforamatsioon. NADH on potensiaalne energiaallikas. Aeroobsetes tingimustes NADH re-oksüdeeritakse elektronide transpordi ahelas oksüdatiivse fosforüleerimise käigus, tekib ATP.
P700 paikneb luumeni poolel. Esineb 2 fotofosforüleerimise tüüpi: (1) atsükliline- osalevad FSII ja FSI, sünteesitakse ATP ja NADPH ning eraldub O2. Iseloomulik Z-skee. (2) tsükliline osaleb ainult FSI, ATP on ainus produkt, O2 ei genereerita ja NADPH ei sünteesita. 5. Süsivesikute süntees Calvini tsüklis pimereaktsioonid. Eristatakse nelja etappi: I etapp: CO2 sidumine pentoossuhkrust aktseptorile (ribuloos-1,5-difosfaat) ning trioossuhkru (3-fosfoglütseraat) teke. CO2 seotakse ribuloos-1,5-difosfaadile ensüümi ribuloos-1,5-difosfaadi karboksülaasi/oksügenaasi (rubisco) poolt. Rubisco on bifunktsionaalne ensüüm, omades lisaks karboksülaasi aktiivsusele ka oksügenaasi aktiivsust, koosneb 8 suurest ja 8 väikesest subühikust. II etapp: 3-Fosfoglütseraadi konversioon glütseeraldehüüd-3-fosfaadiks III etapp: süsivesikute süntees glütseeraldehüüd-3-fosfaadist.
Temperatuur, valguse ja vee kättesaadavus ja mulla toitainete sisaldus 18.Mitu kvanti energiat osaleb minimaalselt ühe molekuli glükoosi moodustamisel?8 kvanti 19.Kust saadakse FS jaoks vabu elektrone?saadakse vee molekuli lõhustumisel,(vee fotolüüsil)? 20.Mis on Rubisco?on CO2 siduv ensüüm, kõige enamlevinud ensüüm Maal 21.Miks nimetatakse enamlevinud FS tüüpi C3 FS? C3 FS tüüpi nim nii seepärast, et FS ajal moodustub 3 süsinikaatomiga 3-fosfoglütseraat 22.Mis on FS valgustuslik kompensatsioonipunkt? Platoo? Mida ma saan nende karakteristikute võrdlemisel eri lehtedel oletada nende 1 lehtede kohta? Valgustuslik kompsensatsioonipunkt on maksimaalne kiirguse kasutamispunkt. Nende karakteristikute võrdlemisel eri lehtedel saab nende lehtede kaudu oletada, kus taim kasvab nt kas vee sees või kuskil kõrgel maismaal.
41. Nimetage fotosüsteem I aktseptorpoolel paiknevad elektronide aktseptorid redokspotentsiaali suurenemise (positiivsemaks muutumise) järjekorras P700 A0 A1 Fes kompleksid (FxFaFb) Fdx 42. Millise redokspotentsiaaliga ühend peab moodustuma, et toimuks elektronide liikumine vee molekulilt fotosüsteem II reaktsioonitsentrisse? Positiivsema redokspotensiaaliga ühend. 43. Kirjutage Calvini tükli esimese reaktsiooni (karboksüleerumine) võrrand ribuloos-1,5-bisfosfaat + CO2 + H2O 3-fosfoglütseraat (2x) 44. Kirjutage Calvini tsükli redutseerumisfaasi reaktsioonid 3-bisfosfoglütseraat + ATP 1,3-bisfosfoglütseraat + ATP 1,3-bisfosfoglütseraat + NADPH glütseeraldehüüd-3-fosfaat + NADP 45. Kirjutage Calvini tsükli üldvõrrand (tsüklisse sisenevad ja tsüklist väljuvad ühendid) 3CO2+9ATP+6NADPH + 5H2O glütseeraldehüüd-3-fosfaat+9ADP+8Pi+6NADP+2H 46. Kirjutage taimedes toimuva fotosünteesi üldvõrrand CO2 + 2H2O + 8hv (C H2O ) + O2 + H2O 47
trüptofaan, fenüülalaniin ja lüsiin. Arginiin ja histidiin on asendamatud ainult lastel. Aminohapped jagunevad biosünteesi lähteühendite järgi perekondadesse: · -ketoglutamaat glutamaat, glutamiin, proliin, arginiin, lüsiin · püruvaat alaniin, valiin, leutsiin, isoleutsiin · oksaalatsetaat aspartaat, aspargiin, metioniin, treoniin, isoleutsiin, lüsiin · fosfoenoolpüruvaat ja erütroos-4-P fenüülalaniin, türosiin, trüptofaan · 3-fosfoglütseraat seriin, glütsiin, tsüsteiin · 5-fosforibosüül-PP ja ATP histidiin Kõige parem lämmastikudoonor on glutamaat. Aminohapete degradatsioon Normaalse toitumise korral ei ole aminohapped peamiseks energiaallikaks, kuid muutuvad metavoolse energia allikaks nälgimise korral ning juhtudel kui toiduga omastatav aminohapete kogus ületab biosünteesi vajadused. Aminohapete katabolism erineb rasvade ja süsivesikute katabolismist selle poolest, et
ladestub Ca-dipikolinaat, sünteesitakse SASP valgud ja spoor omandab termoresistentsuse 9. Spoorid vabanevad vegetatiivse raku autolüüsil o Spoori idanemine: Kiirem protsess, kui moodustumine (1-1,5 h) Idanemist saab ka stimuleerida · Spooride lühiajalise kuumutamisega · Spoorikesta mehhaanilise vigastamisega 1. Algab vee sisseimamisega 2. Hüdrolüüsubkorteksi peptidoglükaan, vabanevad korteksi peptiidid ja Ca-dipikolinaat 3. Fosfoglütseraat konverteeritakse ruttu ATP-ks 4. Varuvalgud hüdrolüüsuvad,andes materjali rakuvalkude ja kesta peptidoglükaani sünteesiks 5. Spoori idanemisest alates 1-2 h möödudes algab DNA süntees 6. Spoori lagunenud kestast väljub kasvutoruke, millest moodustub vegetatiivne rakk o Spoori omadused: Talub hästi kuivust, kiirgust, toksikante Metaboolne aktiivsus on madal mRNA sisaldus on madal Makromolekulide sünteesi ei toimu
Spoorid idanevad, kui tingimused on soodsad (niiskus, toitained jne.). Idanemist saab ka stimuleerida näiteks spooride lühiajalise kuumutamisega või spoorikesta mehhaanilise vigastamisega. Pärast kuumashokki tuleb spoorid kohe söötmele välja külvata, muidu protsess pöördub. Spoori idanemine algab vee sisseimamisega. Hüdrolüüsub korteksi peptidoglükaan, vabanevad korteksi peptiidid ja Ca-dipikolinaat. Fosfoglütseraat konverteeritakse ATP-ks. Varuvalgud hüdrolüüsuvad, andes materjali rakuvalkude ja kesta peptidoglükaani sünteesiks. DNA süntees algab 1-2 tunni möödudes spoori idanemise algusest. Spoori lagunenud kestast väljub kasvutoruke, millest moodustub vegetatiivne rakk. Endospooride säilimine: Spooride säilumist võib ilmselt mõjutada kosmiline kiirgus, mis põhjustab DNA kaheahelalisi katkeid. Kui kiirgus on mõjunud spooridele pikka ega, siis on spoori DNA
Spoorid idanevad, kui tingimused on soodsad (niiskus, toitained jne.). Idanemist saab ka stimuleerida näiteks spooride lühiajalise kuumutamisega või spoorikesta mehhaanilise vigastamisega. Pärast kuumashokki tuleb spoorid kohe söötmele välja külvata, muidu protsess pöördub. Spoori idanemine algab vee sisseimamisega. Hüdrolüüsub korteksi peptidoglükaan, vabanevad korteksi peptiidid ja Ca-dipikolinaat. Fosfoglütseraat konverteeritakse ATP-ks. Varuvalgud hüdrolüüsuvad, andes materjali rakuvalkude ja kesta peptidoglükaani sünteesiks. DNA süntees algab 1-2 tunni möödudes spoori idanemise algusest. Spoori lagunenud kestast väljub kasvutoruke, millest moodustub vegetatiivne rakk. Sporogeensed perekonnad: Bacillus (pulkbakter) ja Clostridium (pulkbakter) Botulism, teetanus ja siberi katk kui sporogeensete bakterite poolt põhjustatud ohtlikud haigused.
Peroksüsoomides toimuvad oksüdatiivsed reaktsioonid. Nimelt peroksüsoomid on põhilised organellid, kus toimub teatud tüüpi rasvahapete oksüdeerimine. Peroksüsoomides ei ole elektroni transpordi ahelat ja rasvhapete oksüdeerumine ei ole seotud ATP moodustumisega ning energia vabaneb soojusena. Peroksüsoomidel on eriti tähtis roll teatud taimekudedes, kus esineb 2 väga erinevat tüüpi peroksüsoomi. Üks tüüp esineb lehtedes, kus ta viib läbi fotorespiratsiooni (glükolaat - fosfoglütseraat - CO2). Teist tüüpi peroksüsoom esineb idanevates seemnetes, kus ta konverteerib seemnete lipiidide koostises olevaid rasvhappeid suhkruteks, mida on noore taime kasvuks vaja. Kuna selline lipiididest suhkrute tegemine käib nn. glüoksülaat-tsükli kaudu, siis vastavaid peroksüsoome nimetatakse glüoksüsoomideks. Ensüümid ei satu pürokspsoomi mitte Golgi kompleksi kaudu, nagu lüsosomaalsed ensüümid,
isomeraas = fruktoos6fosfaat (ehk F6P) F6P + fosfofruktokinaas1(ehk PFK1) = fruktoos 1,6bisfosfaadiks Aldolaas katalüüsib F1,6BP lagunemist kaheks 3C produktiks Aldolaasi reaktsiooni kaks produkti (DHAP ja G3P) on tasakaalus trioosfosfaadi isomeraasi poolt katalüüsitava reaktsiooni kaudu. b. Kus tekib ATP G3P + Glütseeraldehüüd3fosfaadi dehüdrogenaas = 1,3BPG 1,3BPG + Fosfoglütseraadi kinaas = 3 fosfoglütseraat 3PG konverteeritakse esmalt 2PGks fosfoglütseraadi mutaasi toimel ja 2PG omakorda enolaasi reaktsioonis fosfoenoolpüruvaadiks (PEP). PEP+ Püruvaadi kinaas = püruvaat c. Mis on redoksreaktsioon G3P + Glütseeraldehüüd3fosfaadi dehüdrogenaas = 1,3BPG d. Mis on kõige olulisem kontrollreaktsioon PEP+ Püruvaadi kinaas = püruvaat e. Kus tekivad trioosfosfaadid Dihüdroksüatsetoonfosfaat (DHAP) ja glütseeraldehüüd 3fosfaat (G3P) on tasakaalus trioosfosfaadi isomeraasi poolt 16
suspensioonis. 56. Kirjutage Calvini tükli esimese reaktsiooni (karboksüülumine) võrrand ehk CO2 sidumine retseptorile I faas karboksüülumisreaktsioon Reakstiooni katalüüsib RubP karboksülaas (RuBisCo). Ribuloos-1,5-difosfaadi ja CO 2 sidumise tulemusega moodustub 6-süsinikuline labiine vaheprodukt, mis vee osavõtul laguneb 2'ks fosfoglütseraadi molekuliks. RuBP + CO2 + H2O = fosfoglütseraat (3C) + fosforglükolaat (2C) 57. Kirjutage Calvini tsükli redutseerumisfaasi reaktsioonid II faas reduktsiooni ehk taandamisfaas 3-fosfoglütseraadi karboksüülrühmast moodustatakse süsivesikud CO2 + 3 ATP 2 NADPH2 + 2H+ [CH2O] + H2O + 3 ADP + 3 Pi + NADP või ma ei tea kas see sobib, see veits imelik 3-fosfoglütseaat + ATP + NADPH2 = glütseraldehüüd-3-fosfaat + ADP + Pi + NADP+ 58
Vastasel juhul konverteeritaks kogu atsetaat CO2-ks ning rakkude kasvuks vajalikke metaboolseid vaheühendeid ei tekiks. IDH fosforüleerimist viib läbi IDH kinaas/fosfataas, mis on kodeeritud aceK geeni poolt. aceK mutandid ei ole võimelised atsetaadil kui ainsal C-allikal kasvama. AceK kinaasi aktiivsus avaldub siis, kui metabolismi vaheühendite kontsentratsioon rakus on madal (see olukord tekib siis, kui rakud atsetaadil kasvavad). Isotsitraat ja 3-fosfoglütseraat aktiveerivad AceK fosfataasse aktiivsuse ja IDH defosforüleerimise, soodustades sel viisil isotsitraadi metaboliseerimist TCA tsükli kaudu. Valkude metülatsioon Valkude metülatsiooni kaudu reguleeritakse näiteks E. coli rakkude kemotaksisel osalevate membraanseoseliste retseptorvalkude MCP-de (methyl-accepting chemotaxis proteins) aktiivsust. MCP-de metülatsiooni viib läbi CheR metüültransferaas, kasutades metüülrühma doonorina S-adenosüülmetioniini.
Vastasel juhul konverteeritaks kogu atsetaat CO 2-ks ning rakkude kasvuks vajalikke metaboolseid vaheühendeid ei tekiks. IDH fosforüleerimist viib läbi IDH kinaas/fosfataas, mis on kodeeritud aceK geeni poolt. aceK mutandid ei ole võimelised atsetaadil kui ainsal C-allikal kasvama. AceK kinaasi aktiivsus avaldub siis, kui metabolismi vaheühendite kontsentratsioon rakus on madal (see olukord tekib siis, kui rakud atsetaadil kasvavad). Isotsitraat ja 3-fosfoglütseraat aktiveerivad AceK fosfataasse aktiivsuse ja IDH defosforüleerimise, soodustades sel viisil isotsitraadi metaboliseerimist TCA tsükli kaudu. Valkude metülatsioon ja atsetüleerimine Valkude metülatsiooni kaudu reguleeritakse näiteks E. coli rakkude kemotaksisel osalevate membraanseoseliste retseptorvalkude MCP-de (methyl-accepting chemotaxis proteins) aktiivsust. MCP-de metülatsiooni viib läbi CheR metüültransferaas, kasutades metüülrühma doonorina S-adenosüülmetioniini.
HC OH O O HO P O H2C O OH P OH HO Fosfoglütseraat O Ribuloos-1,5-bisfosfaat Ribuloos-bisfosfaadi karboksülaas Ribuloosbisfosfaat + H2O + CO2 2 molekuli fosfoglütseraati Seda ensüümi leidub maailmas kõige rohkem kaalu järgi. Tsitraadi süntaas HO O OH O O O +HC S