Molekulaarbioloogia
Keemiline meetod pohineb nukleotiide valikuliselt lohustavate kemikaalide
kasutamisel. Esmalt margistatakse radioaktiivse isotoobiga DNA ahela uks ots, misjarel
jagatakse margistatud fragmendid nelja katsuti vahel. Kasutades erinevaid kemikaale
lohustatakse uks voi kaks N-alust (A,T,G,C) ahelas (igas katsutis erinevad). Saadakse
erineva
pikkusega DNA fragmente, mille elektroforeetiline uurimine voimaldab maarata
nukleotiidide
jarjestuse.
Ensumaatilise meetodi puhul kasutatakse DNA-polumeraasi abil toimuva topeltahela
sunteesi blokeerimist kindla nukleotiidi kohal. Tulemuseks on jallegi erineva pikkusega
fragmendid, mille elektroforeesil joonistub valja DNA molekuli NH jarjestus.
DNA NH jarjestuse maaramine on aluseks koigile teistele meetoditele
insenergeneetika vallas. See voimaldab leida genoomi piirkonnad, mis kodeerivad
proteiinide
sunteesi ja maarata ka proteiinide aminohappelise koostise.