"ekaatyeqikaavkaaaegemkgvlgyteddvvstdfngevctsvfdakagialndnfvklvswydnetgysn" - 1 õppematerjal

Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).

http://www.ebi.ac.uk/Tools/similarity.html) ja SW modifitseeritud algoritme (MPsrch ja Scanps - http://www.ebi.ac.uk/Tools/similarity.html). Parema tulemuse saamiseks varieerida vajaduse korral parameetreid. RIGRIVFRAAQKRSDIEIVAINDLLDADYMAYMLKYDSTHGRFDGTVEVKDGHLIVNGKKIRVTAERDPANLKWD EVGVDVVAEATGLNFDKYAGQDIVSNASCTTNCLAPLAKVINDNFGIIEGLMTTVHATTATQKTVDGPSHKDWRG GRGASQNIIPSSTGAAKAVGKVLPELNGKLTGMAFRVPTPNVSVVDFRVPTPNVSVVDFRVPTPNVSVVDLTVRL EKAATYEQIKAAVKAAAEGEMKGVLGYTEDDVVSTDFNGEVCTSVFDAKAGIALNDNFVKLVSWYDNETGYSN b. Milline on uuritav valk, millised ortoloogid ja paraloogid leiti erinevatel otsingutel? . ortoloog ­ eri liikidest pärit järjestused, millel on üks ühine eellane 4 paraloog ­ samast liigist pärit järjestused, millel on üks ühine eellane Uuritav valk: Glyceraldehyde 3-phosphate E. Colide puhul esineb nii ortolooge kui paralooge. Näiteks paraloogid: >>UNIPROT:Q6WAN9_ECOLX Q6WAN9 Glyceraldehyde phosphate d (220 aa)