kes sai Johni ema mälestuseks nime Julian Lennon. Viis aastat hiljem nad lahutasid. Põhjuseid oli mitmeid, näiteks: Johni kiire eluviis, uimastitega eksperimenteerimine, soovimatus oma pojaga tegeleda ning armumine Yoko Onosse. Poja hooldusõigus jäi Cynthiale. Lennon ja Yoko Ono tutvusid aga 9. novembril 1966, kui Lennon külastas Ono kunstinäitust. Yoko ja Johni kooselu algas pärast Lennoni Indiast naasmist. Pärast Johni lahutust Cynthiast sai neist paar nii avalikus kui eraelus. Ajakirjandus kirjutas Yoko kohta laimavaid artikleid, mis ajasid Lennoni raevu. Yoko Onol oli suur mõju Lennoni isiksusele ja see tekitas ülejäänud biitlite hulgas vastumeelsust, mida võimendas veel asjaolu, et Yoko oli Johniga kaasas praktiliselt igal salvestussessioonil. Biitlite lõpuaastail korraldas Lennon koos oma naisega poliitilisi proteste,
Ono elas üle ka Tokyo pommitamise 1945. aastal. Peale sõda kolis perekond taas New Yorki, kuhu jäädigi elama. Yoko käis seal koolis ning talle hakkas huvi pakkuma kunst. 1956. aastal abiellus Ono Toshi Ichiyanagiga. 1962. aastal lahutati ning Ono abiellus Ameerika jazz-muusiku Anthony Coxiga. 1963. aastal sündis neile ka tütar. 1969. nad lahutasid pärast mitu aastat eraldi elamist. Lennon ja Ono tutvusid 1966. aastal Yoko Ono kunstinäitusel. Pärast Johni lahutust Cynthiast sai neist paar nii era- kui ka avalikus elus. Onol oli suur mõju Johni isiksusele ning teistele The Beatles liikmetele see ei meeldinud. Yoko oli Johniga kaasas peaaegu kõikidel loosalvestustel. Lennon on viidanud Onole paljudes oma lauludes. Neid tuntakse kui Plastic Ono Bandina, kuna nad on koos laulnud sisse väga mitmeid laule ning albumeid. Kui John kutsuti mõnele kontserdile esinema, läks temaga kaasa ka Yoko. 1968. aastal jäi Ono rasedaks, kuid rasedus katkes