"cqrafscpl" - 1 õppematerjal

Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).

RSPFIYKCTTCASAGQKRRVAQVTVLEEPVL**HLRGCIAEVIERLATFIIGYRG*IPW V Sbjct 4331280 RSPFIYKCTTCASAGQKRRVAQVTVLEEPVL**HLRGCIAEVIERLATFIIGYRG*IPWV 4331101 Query 266 VTRSVRSRAFRKWWSTSG*K**RSIALRPPVFRSSLVPRLKMDPLTRGSYV*NCCLQIWR 87 VTRSVRSRAFRKWWSTSG*K**RSIALRPPVFRSSLVPRLKMDPLTRGSYV*NCCLQIW R Sbjct 4331100 VTRSVRSRAFRKWWSTSG*K**RSIALRPPVFRSSLVPRLKMDPLTRGSYV*NCCLQIWR 4330921 Query 86 YQRS*F*RHEPQR*YCAF*CQRAFSCPL 3 YQRS*F*RHEPQR*YCAF*CQRAFSCPL Sbjct 4330920 YQRS*F*RHEPQR*YCAF*CQRAFSCPL 4330837 Sarnaseid järjestusi leiti veel näiteks organismides: Shigella Klebsiella Enterobacter Yersinia pseudotuberculosis b. Analüüsida tulemusi ­ mis liik, mis geenid ja valgud. Milline algoritm oli kõige tundlikum. Esimene meetod andis esimese tulemusena E. Coli aspartokinaasi III, teine meetod pakkus hohkem erinevaid variante, esimene valk oli E. Coli kas aspartokinase III või glucosephosphate isomerase