TKT-sse lõplikuks lõhustumiseks. Iga B-OX ring toodab FADH2, NADH, mida reoksüdeeritakse mitokondriaalses hingamisahelas kuni 15 ATP-ks. B-OX funktsiooniks on atsetüül- CoA tootmine (eriti ketokehade tootmiseks) , ATP tootmine ( eriti glükoneogeneesi jaoks), metaboolse vee tootmine (0,3...0,4 liitrit päevas). B-OX intensiivistub paastumise, nälgimise ja diabetes mellitus puhul. B-OX vajab karnitiini, pantoteenhape, riboflaviini, nikotiinhape. B-OX-ga seotud haigused: atsüül-CoA DH defitsiit, keskmiseahelaga atsüül-CoA DH defitsiit (ohtlik hüpoketootiline hüpoglükeemia, letargia, oksendamine, hepatomegaalia, mõnikord närvisüsteemi häired, mis võivad lõpeda koomaga), väikelaste äkksurma sündroom, Reye sündroom. Peroksüsomaalne B-OX Funktsioonid: 1) Pikkade ahelatega rasvhapete lõhustamine lühemateks 2) Rasvhapete liigsuse likvideerimine ja samaaegne ATP tootmine 3) Kolesteriidi rasvhappeahelate lühendamine sapphapete formeerumiseks
+ FADH2 + GTP + CoA + 2CO2 + 2H+ + HSCoA) Süsivesikute, lipiidide, aminohapete metabolism TKT tähtsus Energia kasutamine: (1 ATP, 3 NADH, 1 FADH2)= 12 ATP TKT talitluse ja häirete meditsiinilised aspektid TKT funktsioneerimishäired organismile ohtlikud ja kriitilised väga intensiivse aeroobse metabolismi kudedes. TKT vajadus Tiamiin, riboflaviin, pantoteenhape, nikotiinhape, lipoehape Regulatoorsed ensüümid TKT talitluses ATP/ADP/AMP, GTP/GDP/GMP, NADPH/NADH/NAD, sukstinüül-CoA, Ca2+, atsüül-CoA, hormoonid TKT kontrollpunktid Tsitraadi süntaas- ATP, NADH, sukstinüül-CoA ja atsüül-CoA allosteeriline inhibeerimine Isotsitraadi DH- ATP ja NADH allosteeriline inhibeerimine. (Mg ja Ca defitsiit-> ensüümi töö) AKGDH-(3 ensüümi+ 5 vitamiini)- ATP, NADH, GTP ja sukstinüül-CoA allosteeriline inhibeerimine TKT respiratoorne kontroll NAD ja FAD pidev varustamine hingamisahela poolt Oksüdatiivse fosforüülimise sõltuvus ADP/ATP suhest TKT anaboolne (biosünteetiline) tähtsus
liigub sellest vabaneva energia tulemusel sisse. Pi transportimiseks vajalik energia pärineb prootonite voost. Rasvhapete oksüdatsioon Rasvhapete energiat saab kasutada ainult aeroobsetes tingimustes. Kuna kõik aeroobsed ainevahetusprotsessid toimuvad mitokondrites (sest ainult seal on sobivad ensüümid), siis tuleb rasvad ka transportida kõigepealt mitokondrisse. Selleks moodustub tsütoplasmas rasvhappe jäägi ja CoA kompleks – atsüül CoA. Iga molekuli atsüül CoA tekkeks kulutatakse 2ATP hüdrolüüsi jagu energiat. Mitokondri sisemembraani läbimiseks moodustub veel transpordikompleks karnitiiniga, atsüülkarnitiin, millest mitokondri maatriksis taastatakse atsüül CoA. Rasvhappe molekuli (atsüül CoA) lagundamine toimub järk-järgult ning selle protsessi käigud eemaldatakse rasvhappe süsinikahelast kahe C aatomi pikkused fragmendid ning töötatakse need ümber atsetüül CoA ühikuteks. Need
saab kasutada glukoneogeesiks (glukoosi biosunteesiks) voi edasiseks konverteerimiseks puruvaadiks ning lohustumiseks tsitraaditsuklis 7. Mis on rasvhapete oksüdatiivse lagundamise põhiline metaboolne rada? Kirjeldage lühidalt. Rasvhapete oksudatsiooni pohirada on β-oksudatsioon, mille tulemusel eraldub rasvhappe ahelast 2-susinikuline molekul. Toimib mitokondrite membraanis, rasvhapet transpordib karnitiin Atsüül-CoA→trans-enoüül-CoA→L-hüdroksüatsüül-CoA→β-ketoatsüül-CoA→Atsüül- CoA(lühem)+Atsetüül-CoA 8. Mis on ajukoe peamine energiallikas? Miks? Ainus energiaallikas aju jaoks, glükoos läbib piisava kiirusega hemato-entsefaliitset barjääri, suudab tagada ajukoe energiavajadused. Aju kasutab 110-130g glükoosi ööpäevas. 9. Kirjeldage nii üksikasjalikult kui suudate aminohapete aminorühma lõhustumise etappe. Aminohapete α-aminorühm kantakse α-ketoglutaraadile, mille tulemusel tekib glutamaat,
+ CO2 H3O R X + Mg RMgX RCOOMgX RCOOH Et2O Seda karboksüülhapete sünteesi rakendatakse primaarsete, sekundaarsete, tertsiaarsete, alüül-, bensüül- ja arüülhalogeniidide puhul, eeldusel, et neis puuduvad teised Grignardi reagentidega reageerivad rühmad. Nukleofiilne liitumine-elimineerimine atsüül-süsiniku juures Eespool aldehüüdide ja ketoonide puhul vaadeldi nukleofiilse liitumise reaktsiooni karbonüülsele süsinikule. Karboksüülrühma puhul järgneb liitumisele elimineerimine. Sellise mehhanismiga kulgeb palju reaktsioone. H R Nu+ Nu .. - Nu
kolesterooli ja kolesteriidide trantsport perifeersetest kudedest maksa; 10. Lipoproteiinide ehitus: kolesterooliestrid ja rasvad on ümbritsetud fosfolipiidmembraaniga (monokiht), milles paiknevad kolesterooli ning valgud apoliproteiinid. Joonist vaata loeng 23 slaid 30. Funktsioon: trantsportivad vees lahustumatuid lipiide vereringes. 11. Maksarakkude mitokondrites toimub ketokehade (=ketoonkehade) süntees. Sünteesi lähteaineteks on atsüül- CoA. Ketokehadena tuntakse: atsetooni (CH3 CO CH3), atsetoatsetaati (CH3 CO CH2 COO-)ja hüdroksübutüraati (CH3 CHOH CH2 COO-). 12. Ketogeneesi (ketokehade süntees) aktiivsus tasakaalustatud ainevahetuses on tagasihoidlik, aga diabeedikute puhul aktiivsus suurenenud. Bioloogiline roll: energiaallikas teatud kudedes (maksas). Omavad mõningat tähtsust energiaallikana ajus st energiaallikas ajule nälgimisperioodil, südame ja skeletilihastes.
-aminovõihape (neurotransmitter). Glu on ka ajukoe energeetiline substraat. Liigne Glu võib põhjustada nn. hiina köögi sündroomi kuumatunne, punetus Lisaainetena E620 E625, glutamiinhape, Na-glutamaat kasutatakse Aasia köögis, K-glutamaat., Mg-diglutamaat jt. Aminohapet l-karnitiini soovitatakse toidulisandina energiajookides. Karnitiinensüümi abil transporditakse rasvhapped mitokondritesse, kus toimub aktiveeritud rasvhapete (atsüül- CoA) -oksüdatsioon. Osa meedikuid kinnitavad, et kehaomasel aminohappel Lkarnitiinil on positiivne toime südamele ning see parandab ka ainevahetust. L-karnitiin vähendab kolesterooli ja triglütseriidide taset veres ja väidetavalt mõjub hästi ka diabeetikutele vähendades glükoosi hulka. Väidetakse, et pärsib ka dementsuse ja Alzheimeri tõve kulgu.
Rasvhapete täielik oksüdatsioon CO2-ka ja H2O-ks toodab rohkesti ATP-d. Rasvhappe lagundamise metaboolne rada on -oksüdatsioon, mille tulemusel eraldub rasvhappe ahelast 2-süsinikuline molekul. -oksüdatsioon toimub mitokondite maatriksis. -oksüdatsiooniks on vajalik rasvhappe aktiveerimine, mis toimub mitokondrite välismembraanis. Rasvhappe molekulile lisatakse CoA molekul, mille tulemusel tekib atsüül-CoA. Ensüümiks on rasvhappe atsüül-CoA süntetaas. Atsüül-CoA transporditakse mitokondrite maatriksisse karnitiini (vitamiin Bt) abil, sest pikaahelalised rasvhapped ei suuda vabalt läbida mitokondrite membraani. Mitkondri maatriksis algab -oksüdatsioon. -oksüdatsiooni ühes ringis erladub 1 FADH 2 molekul ja 1 NADH molekul. 8. Mis on ajukoe peamine energiaallikas? Miks? Ajukoe peamine energiaallikas on glükoos, sest aju ei ole suuteline lagundama rasvasid ja lipiide. Pikemaajalise nälgimise korral saab aju energiat ketokehadest
nukleofiilse ataki abil Püridoksiin (B6) Püridoksaalfosfaat (aminorühmade moodustamine) Kobalamiin(B12) 5´-Desoksüadenosüülkobalamiin (saab ainult loomsest toidust) osaleb rektsioonides, kus 1) toimub intramolekulaarne ümberasetus; 2) ribonukleotiidid taandatakse desoküribonukleotiidideks; 3) toimub metüülrühma ülekanne Biotiin Biotiin-lüsiinkompleks(Biotsütiin) CO2 Karboksüleerimine Lipohape Lipoüül-lüsiin kompleks (Lipamiin) funktsiooniks on ühendada atsüül-rühma ülekanne ja elektroni ülekanne alfa-ketohapete oksüdatsiooni ja dekarboksüleerimise reaktsioonide käigus Foolhape Tetrahüdrofolaat folaadid on 1-C ühikute ülekandjaks igal süsiniku oksüdatsiooni tasandil va CO2 oma
Viimased tungivad kapillaaridesse, kus nad transporditakse maksa ja teistesse organitesse. 3. Rasvhapete -oksüdatsioon on rasvhapete oksüdatiivne degradatsioon atsetüül-CoA-ks, mis toimub mitokondrites. Eelduseks on rasvhapete aktiveerimine CoA-ga: Rasvhappe-CoA süntetaas kondenseerib rasvhapped CoA-ga samaaegselt ATP hüdrolüüsiga AMP-ks ja PPi-ks. rasvhappe karboksülaat atakeerib ATP ning moodustab atsüül-adenülaat vaheühendi. CoA ataki tulemusena atsüüladenülaadile moodustub atsüül-CoA tioester. Lühikesed rasvhapped kantakse otse mitokondri maatriksisse. Pikkade rasvhapete CoA estrid konverteeritakse kõigepealt atsüülkarnitiinideks ning seejärel transporditakse translokaasi poolt läbi mitokondri sisemembraani. Rasvhapete -oksüdatsioon on 4 reaktsioonist koosnevate tsüklite korduv jada 1.reaktsioon: C-C sideme oksüdeerimine atsüül-CoA dehüdrogenaasiga
membraanilipiidide klass Fosfolipaasid on glütserofosfolipiidi hüdrolüüsivad ensüümid Sfingosiin- 18C aminoalkohol, trans kaksiksidemega Erinevad fosfolipaasid atakeerivad erinevaid sidemeid Tseramiidid- sfingosiini N-atsüül derivaadid Fosfolipaaside produktid on mõnikord signaalmolekulid Rasvhape 16, 18, 22, 24 (:0 või :1) lüsofosfatidaathape 1,2-diatsüülglütseriid NB! Pange tähele sfingolipiidide ja glütserofosfolipiidide
Põhirada on -oksüdatsioon, mille üldjooned on järgmised: 1)rasvhappe -oksüdatsioon (oksüdatsioon ahela -süsiniku osalusel) on mikokondrite maatriksis toimuv tsükkel, millesse lülitumiseks peab rasvhape aktiveeruma. 2) -oksüdatsioon üks ring eraldab rasvhappe ahelast 2-süsinikulise aktiivse atsetüüljäägi (atsetüül-CoA vormis). Rasvhapete aktivatsioon ja transport mitokondritesse: Plasmaalbumiinilt rakku võetud rasvhape aktiveeritakse tsütoplasma rasvhappe atsüül-CoA-süntetaasi (tiokinaasi) toimel, st tekib rasvhappe aktiivvorm ehk atsüül-CoA. Kuna see ei läbi mitokondrite sisemembraani, transporditakse atsüüljääk järgnevalt karnitiini (vitamiin B T) abil mitokondrisse.(joonis õpik II, lk 108, joonis 74). Rasvhapete -oksüdatsioon: See metaboolne rada on 4 reaktsioonist koosnev tsükkel. Tsükli ühe ringiga lühendatakse rasvhappe ahelat 2-süsinikulise atsetüüljäägi võrra. Atsetüüljääk väljub -oksüdatsioonist atsetüül-CoA vormis
Kuna kalarasv sisaldab rohkesti polüküllatumata rasvhappeid, on soovitav kala süüa vähemalt 2 korda nädalas. 6.2.5. Lipiidide metabolism Rasvhapped kulutatakse 3 viisil: · Oksüdeerumine CO2 + H2O + ATP · Varurasv · Struktuursete lipiidide süntees, asendamatute rasvhapete kasutamine Aminohapet l-karnitiini soovitatakse toidulisandina energiajookides. Karnitiinensüümi abil transporditakse rasvhapped mitokondritesse, kus toimub aktiveeritud rasvhapete (atsüül- CoA) -oksüdatsioon. Osa meedikuid kinnitavad, et kehaomasel aminohappel Lkarnitiinil on positiivne toime südamele ning see parandab ka ainevahetust. L-karnitiin vähendab kolesterooli ja triglütseriidide taset veres ja väidetavalt mõjub hästi ka diabeetikutele vähendades glükoosi hulka. Väidetakse, et pärsib ka dementsuse ja Alzheimeri tõve kulgu. Karnitiinisisaldus mõningates toiduainetes , mg/100g veiseliha 95mg veise hakkliha 94mg
-dikarbonüülühenditest moodustunud enolaatidega saab läbi viia alküülimise ja atsüülimise reaktsioone. O O O O O O 1) NaOR 2) R X CH3 C C C OR CH3 C C .. C OR CH3 C C C OR - (või atsüül) H R Claiseni kondensatsioon (-ketoestrite süntees) Etüülatsetaadi reaktsioonil naatriumetoksiidiga kulgeb kondensatsioonireaktsioon ning pärast reaktsioonisegu hapestamist saadud produkt on -keto-ester - etüülatsetoatsetaat (atsetoäädikhappe-ester). Seda tüüpi kondensatsioonireaktsioone nimetatakse Claiseni kondensatsioonideks. Claiseni kondensatsiooni esimeses etapis toimub aldoolliitumine
NADH, tekib 1 NADPH · ACP derivaadid saadakse CoA derivaatidest transatsülaaside toimel · Malonüül-CoA tekib AcCoA-st karboksüleerimisel (Biotiin, ATP!) Rasvhapete -oksüdatsioon toimub mitokondrite maatriksis. -oksüdatsiooniks on vajalik rasvhappe aktiveerimine, mis toimub mitokondrite välismembraanis (rasvhappe molekulile lisatakse CoA molekul, mille tulemusel tekib atsüül-CoA). Atsüül-CoA transporditakse mitokondrite maatrikssise karnitiini abil. Mitokondrite maatriksis algab -oksüdatsioon. Rasvhapete kataboliseerimine b-oksüdatsioonil toimub: · Maksas · Südames · lihastes 12. Selgitage DNA polümeraaside rolli replikatsiooniprotsessis. Miks vajavad DNA polümeraasid toimimiseks praimereid ja mida praimerid endast kujutavad? DNA-polümeraas sünteesib mõlema DNA ahelaga komplementaarsed uued DNA ahelda,
ja 40 kcal glükoosis. Kui sama energa oleks salvestatud glükogeenis siis peaks inimese kaal olema 55 kg suurem. Mida rasvasem inimene on seda rohkem energiavarusid tal on. 6. Kirjeldage triglütseriidide lagundamist. Triglütseriidide Biosunteesi etapid: · Glutserooli aktivatsioon glutserool-3-fosfaadi tekkega · Rasvhapete aktivatsioon atsuul-CoA tekkega · Triglutseriidi biosuntees glutserool-3-fosfaadist ja atsüül-CoA-st Triglütseriidide lagundamine energia saamise eesmärgil toimub mitmes etapis: · Triglütseriidid lagundatakse adipotsüütides rasvhapeteks ja glütserooliks: o vabanenud rasvhapped läbivad adipotsüüdi membraani ja seotakse verealbumiini poolt, mis transpordib nad energiat vajavatesse kudedesse, kus nad difundeeruvad rakkudesse. · Rasvhapped transporditakse energiat vajavate kudede rakkude mitokondritesse,
soodustavad lipolüüsi Rasvhapete saatus - Aadipotsüütides toimuv lipolüüs vabastab rasvhappeid - Need läbivad adipotsüütide membraani ja seotakse koheselt verealbumiini poolt - Neid transporditakse kiiresti kudedesse (maksa ja lihastesse) kus nad difundeeruvad koerakkudesse - Aktiveeritakse tsütosoolis atsüül-CoA süntetaasi poolt ja transporditakse karnitiini (vit B11 või BT) abil mitokondritesse oksüdatsiooniks ATP Glütserooli saatus - Vabaneb rasvkoest (lipolüüs), võetakse maksa ja aktiveeritakse glütserool- 3-P-ks Glütserool-3-p kasutatakse - Lõhustatakse ATP saamiseks (glükolüüsil läbi DAP) saagis 22 ATP! - Glükoneogenees (substraat) - TG sünteesiks Rasvhapete oksüdatsioon beeta-oksüdatsioon
Protsessi algatab hormoon-sõltuv TG lipaas, mis vabastab asendist 1 või 3 rasvhappejäägi. Tekkinud diglütseriidi (DG) lõhustab DG lipaas. Saadud monoglütseriidi lõhustab MG'i lipaas rasvhappeks ja glütserooliks. Ehk TG lõhustumine vabadeks rasvhapeteks ja glütserooliks toimub adipotsüütides, mil lipolüüsi käivitab TG lipaas, mis aktiveerub lipolüütiliste hormoonide toimel. Rasvhapete B-OX on rasvhappe aktiivvormi (atsüül-CoA) oksüdatsiooni beeta-süsiniku osalusel mitokondrite maatriksis. 1 B-OX ring eraldab rasvhappe ahelast 2-süsinikulise aktiivse atsetüüljäägi (atsetüül-CoA vormis), st 1 ringiga lüheneb rasvhappe ahel 2 C võrra. Iga B-OX ring lubab toota kuni 15 ATP molekuli koostöös TKT (trikarboksüülhapete tsükkel) ja hingamisahela. 39. Rasvhapete ja triglütseriidide biosüntees. Atsidoos ja ketoos.
struktuur sõltus sellest, kas märgitud oli paaris või paaritu C aatomite arvuga rasvhape. 6. AtsüülCoA sünteesireaktsioon. 7. Analüüsida karnitiini struktuuri ja funktsiooni rasvhapete transpordil mitokondrisse. Tsütosoolis paiknev karnitiini atsüültransferaas I katalüüsib pööratavat reaktsiooni, mille tulemusena CoA tioesterside vahetatakse karnitiini estersideme vastu. Et rasvhappe kataboliseerimiseks on vajalik molekul mitokondrisse viia ja see toimub atsüül-karnitiini transpordi teel, on karnitiini atsüültransferaas I oluline kontrollpunkt rasvhapete kataboliseerimisel. Atsüül-karnitiin on ligandiks spetsiifilisele transporterile, karnitiini / atsüülkarnitiini antipordile. Mitokondrisse transpordituna on atsüülkarnitiin substraadiks karnitiini atsüültransferaasile II, mis taastab atsüülCoA molekuli ja vaba karnitiini 8. Loetlege 4 oksüdatsiooni tsükli reaktsiooni. NAD+ ja FAD funktsioonid rasvhapete
1. Lipaaside toime triglütseriididele rasvkoes, lipolüüs: 2. Rasvhapete transport veres: 3. Rasvhapete transport läbi mitokondri membraani – karnitiini roll selles protsessis: Rasvhapete energiat saab kasutada ainult aeroobsetes tingimustes. Kuna kõik aeroobsed ainevahetusprotsessid toimuvad mitokondrites (sest ainult seal on sobivad ensüümid), siis tuleb rasvad ka transportida kõigepealt mitokondrisse. Selleks moodustub tsütoplasmas rasvhappe jäägi ja CoA kompleks – atsüül CoA. Iga molekuli atsüül CoA tekkeks kulutatakse 2ATP hüdrolüüsi jagu energiat. Mitokondri sisemembraani läbimiseks moodustub veel transpordikompleks karnitiiniga, atsüülkarnitiin, millest mitokondri maatriksis taastatakse atsüül CoA. 4. Rasvhapete -oksüdatsioon mitokondri maatriksis - 2C-aatomiliste fragmentide eemaldamine rasvhappe molekulist, nende ümbertöötamine atsetüül-CoA-ks, viimase sisenemine Krebsi tsüklisse: 5
hormoonide kontrolli all. Protsessi algatab hormoon-sõltuv TG lipaas, mis vabastab asendist 1 või 3 rasvhappejäägi. Tekkinud diglütseriidi (DG) lõhustab DG lipaas. Saadud monoglütseriidi lõhustab MG'i lipaas rasvhappeks ja glütserooliks. Ehk TG lõhustumine vabadeks rasvhapeteks ja glütserooliks toimub adipotsüütides, mil lipolüüsi käivitab TG lipaas, mis aktiveerub lipolüütiliste hormoonide toimel. Rasvhapete B-OX on rasvhappe aktiivvormi (atsüül-CoA) oksüdatsiooni beeta-süsiniku osalusel mitokondrite maatriksis. 1 B-OX ring eraldab rasvhappe ahelast 2-süsinikulise aktiivse atsetüüljäägi (atsetüül-CoA vormis), st 1 ringiga lüheneb rasvhappe ahel 2 C võrra. Iga B-OX ring lubab toota kuni 15 ATP molekuli koostöös TKT (trikarboksüülhapete tsükkel) ja hingamisahela. Rasvhapete -oksüdatsioon on organismi energiatootmise üks peamistest ainevahetuse radadest ning skeletilihaste ja südamelihase peamiseks energiallikaks
kasutatakse sama ensüümi poolt. Näiteks: alkohol:NAD+ oksüdoreduktaas (alkoholdehüdrogenaas), kus alkohol on doonor ning NAD+ on akseptor. EC 2. Transferaasid ja nende süstemaatilised nimetused: Transferaasid katalüüsivad rühmade ülekannet ühelt molekulilt teisele: X-Y + Z X + Z-Y , kus Y on ülekantav rühm. Need ensüümid kannavad C, N, P või S sisaldavaid gruppe (alküül, atsüül, aldehüüd, amino, fosfaat või glükosüül) ühelt substraadilt teisele. Metüültransferaasid metüülrühmade ülekanne Atsüültransferaasid atsüülrühmade ülekanne Aminotransferaasid aminorühmade ülekanne Glükosüültransferaasid glükosüüljäägi ülekanne Ketotransferaasid k etorühmade ülekanne Transferaaside süstemaatilised nimetused:
LIISI KINK 31 BIOKEEMIA test I Fosforüülensüüm Atsüülensüüm Glükosüülensüüm Nukleofiilse katalüüsi puhul ensüümi mõni nukleofiilne tsenter (amiin, karboksülaat, hüdroksüül, imidasool, tiool) atakeerib substraadi elektrofiilset tsentrit (fosforüül-, atsüül-, glükosüülrühm). Elektrofiilne katalüüs esineb väga harva, siis osalevad koensüümide elektrofiilsed tsentrid. 2. Hape-alus katalüüsi põhimõte, ,,spetsiifiline" ja ,,üldine" hape-alus katalüüs. Seriinproteaaside esindajad, ,,katalüütiline triaad" ja selle roll katalüüsis. Üldine hape-alus katalüüs on katalüüs, mille puhul siirdeseisundis kantakse üle üks prooton. ,,Spetsiifilises" hape-alus katalüüsis osaleb kas H+ või OH-, mis
eukarüooti). GacS-GacA süsteem on üks paremini kirjeldatud P. aeruginosa signaalisüsteemidest, mille abil bakter reguleerib nii akuutset kui ka kroonilist infektsiooni. Mõlemad funktsionaalsed valgud GacS ja GacA on vajalikud taimede, nematoodide, putukate ja imetajate nakatamiseks ning bakteri patogeneesiks. GacS-GacA süsteem on vajalik virulentsusgeenide aktiveerimiseks, kui ka kroonilise infektsiooni korral biofilmi ja N-atsüül-homoseriini (hulgatunnetuse signaalmolekul) geenide aktiveerimiseks ja liikumisgeenide transkriptsiooni pärssimiseks. Vaatamata sellele, et GacS-GacA on põhjalikult uuritud kahekomponentne signaalsüsteem, pole pseudomoonastes teada, mis on signaaliks, mida GacS vastu võtab. Sugukonna Enterobacteriaceae liikidel on teada, et GacS paraloog BarA tunnetab orgaaniliste hapete nagu atsetaadi kogunemist keskkonda. GacS on hübriidne sensorkinaas, mis kannab fosfaatjäägi GacA-le, mis on
kontsentratsiooniga. Kui leiame k1 ja k2, siis saame välja arvutada, et kui suur peab olema atsetaadi konts teises reaktsioonis, et oleks sama kiiruskonstant kui esimest järku reaktsiooni puhul. [S] Et=13M on atsetaadi konts, mis tagaks võrduse, 13M vaba rühm kompenseeriks aspiriini reaktsioonis katalüütilist rühma. See oli happe-aluse katalüüs. Nukleofiilses katalüüsis on efektiivsed kontsid hoopis kõrgemad. Aspiriini derivaat (estersideme ülekanne, atsüüli ülekanne) atsüül kantakse happele üle Esimest järku reaktsioon, mõõdetud kiiruskonstant k10,02 s-1 . Intramolekulaarne ülekanne Analoogne molekul + anhüdriid...+... Teist järku reaktsioon, mõõdetud kiiruskonstant k210 -10 S-1M-1. Intermolekulaarne ülekanne. Monomolekulaarses rekatsioonis ei lähe entroopiat kaduma. * slaidil tähistab üleminekuolekut ja üleminekuoleku parameetreid. Bimolekulaarnse ja monomolekulaarnse reaktsiooni energia erinevused on eksponendis vms. S bi- ja
annaabi.ee 
