Mõisted: pärilikkus - organismide omadus säilitada ja järglastele edasi anda tunnuste kujunemise ja arenemise iseärasusi kromosoom - sisaldab ainet, mis sisaldab ja säilitab pärilikku informatsiooni. geen - DNA lõik, mis osaleb organismi ühe või mitme tunnuse kujunemises. allele - geeni vorm dominantne allele - allel, mis valitseb teise üle ja mille poolt määratud tunnus organismil alati avaldub. retsessiivne allele - allasurutud allel viljastumine - munaraku ja seemneraku ühinemine, millele järgneb nende rakkude tuumade ühinemine esmased sugutunnused - sugunäärmed ja suguelundid teised sugutunnused - habe, madal hääl, lihastik, laiad õlad jne muutlikus - organismide võime muutuda ning seetõttu üksteisest erineda. mutatiivne muutlikus - muutused geenide või kromosoomide ehituses või kromosoomide arvus mutagen - mutatsioone põhjustavad tegurid
valgu sünteesi tähistavad kolm koodonit UGA, UAA, UAG Monohübriidne nim. ristamine mille puhul vormid erinevad ühe tunnuse poolest allelid ühe geeni erivormid homosügootsus geenipaari seisund, mille mõlemas homoloogilises kromosoomis paikneb vaadeldava tunnuse suhtes sama alleel heterosügootsus geenipaari seisund, mille puhul mõlemas homoloogilises kromosoomis paikneb vaadeldava tunnuse suhtes erinevad alleelid dominantne nim. Allele, mille poolt määratud tunnus heterosügootses olekus avaldub retsessiivne nim. Allele, mille poolt määratud tunnus heterosügootses olekus ei avaldu Mendeli I seadus: (ühetaolise seadus) homosügootsete vanemate dihübriidsete ristamisel saadakse esimses põlvkaoonas genotüübilt identsed ja fenotüübilt sarnased järglased Mendeli II seadus: (lahknemisseadus) homosügootsete vanemate monohübriidsel ristamisel
1. (a) (i) gene length of DNA; codes for a (specific), polypeptide / protein / RNA; max 1 allele alternative form of a gene; found at a, locus / particular position on, a chromosome; max 1 (ii) assume allele refers to coat colour allele (coat colour) gene / alleles, only on X chromosome; A no (coat colour), gene / allele, on Y chromosome male cats, XY / only have one X chromosome; males have only one (coat colour) allele / cannot have two (coat colour) alleles; need black and orange alleles for tortoiseshell colour; 2 r r w w
Retsessiivne alleel a on alleel, mis avaldub ainult homosügootses organismis. Domineeriv alleel A on alleel, mis avaldub heterosügootses organismis. Homosügoot- vaadeldav tunnus on määratud ühesuguste alleelidega (AA, aa). Heterosügoot- vaadeldav tunnus on määratud erinevate alleelidega (Aa, Bb). Polüalleelsus geenifondi omadus, mille korral ühe fenotüübilise tunnuse määramisel osaleb populatsioonis rohkem kui kaks alleeli. Intermediaarsus geenipaari seisund, mille puhul kumbki allele ei domineeri ja heterosügootse genotüübiga isendil avaldub vahepealne tunnus. Polügeensus genotüübi omadus, mille korral isendi ühe tunnuse määramises osaleb samaaegselt mitu mittealleelset geeni. Genotüüp- ühe isendi geenid (nt. AA, Aa, aa). Domineerivad tunnused inimestel: kõrvanibud vabalt, normaalne nägevus ja kuulmine, mittepunapäisus, pruunid silmad, tedretähnilisus. retsessiivsed tunnused: kurtus, lühinägevus, normaalne pöial, naerulohukeste puudumine,
Ka ühetaolisuse seadus 9. Mendel II seadus- homosügootsete vanemate dihübriidsel ristamisel toimub teises hübriidpõlvkonnas genotüüpide ja fenotüüpide lahknemine seaduspärastes suhetes. Ka lahknemisseadus. 10. Analüüsiv ristamine- ristamine, millega uuritakse katseloomade või taimede genotüüpide homo- ja heterosügootsust. 11. Intermediaarsus- vahepealne tunnus( domineerimisnähtus puudub) 12. Polüalleelsus- allele on rohkem kui kahe variandina, iseloomustab populatsioon. 13. Dihübriitne ristamine- ristamine,mille puhul jälgitakse 2 tunnusepaari pärandumist. 14. Mendeli III seadus- homosügootsete vanemate dihübriidsel ristamisel lahknevad mõlemad tunnusepaarid teised hübriidpõlvkonnas teineteisest sõltumatult ja kombineeruvad omavahel vabalt. Ka lahknemise seadus. 15. Sugukromosoom- idendi soo määrav kromosoom, mille arv on erinevatel sugupooltel erinev.
Mikroevolutsioon - liigi sisene evolutsioon, populatsioonide muutumine ja kohastumine. Väikseim evolutsioonivõimeline organismirühm on populatsioon . Populatsiooni iseloomustab: - Genofond - Geneetiline struktuur - Liigi levila ehk areaal Evolutsiooni tegurid: 1. Mutagenees (mutatsioonid) 2. Kombinatiivne muutlikus 3. Geenivool (geenisiire) rändamine 4. Geenitriiv juhuslik kõikumine 5. Looduslik valik 1. Geenmutatsioonid tekitavad uusi allele ja mõnikord ka uusi gene. Äädikkärbsetel geenmutatsioonid avalduvad mõnedes tunnustes: tiivad, kehavärvus, silmavärvus, peakuju .Kromosoommutatsioonid põhjustavad muutusi geenide paiknemises ja kordsuses. Genoommutatsioonide tagajärjel muutub kromosoomide arv. Mutatsioonid 2.Alleelide kombineerumine sugulisel paljunemisel · Meiosis - kromosoomide ristsiire · Viljastumisel - alleelide kombineerumine 3
MÕISTED LK 167 Alleel- ühe geeni erivorm Analüüsiv ristamine ristimine, millega uuritakse katseloomade või taimede genetüüpide homo- ja heterosügootsust Autosoom kromosoom, mis esineb võrdsel arvul liigi kõigil normaalsetel isenditel ega sõltu nende soost Daltonism (punarohepimedus) inimesel esinev suguliiteline puue, mis tuleneb retsessiivsetest alleelidest X-kromosoomis Dihübriidne ristamine ristamine, mille korral uuritakse kahe geenipaari poolt määratud kahe tunnusepaari pärandumist Dominantne allele- alleel,mille poolt määratud tunnus avaldub heterosügootses olekus Geenide aheldus- Üht tunnust määravad geenid paiknevad lähestikku ühes kromosoomis ja päranduvad seetõttu aheldunult. Genealoogiline meetodindiviidi genotüübi väljaselgitamine sugupuu koostamise abil Hemofiilia(vere hüübimatus)..sama jutt, mis daltonismi kohta Heterosügootne organism - Geenipaari seisund, mille puhul homoloogilistes kromosoomides paiknevad vaadel...
during the initial stage of development of plant-pathogenic corn smut fungus Ustilago maydis, underlying the importance of SNAREs for both partners of plant-microbe interaction. · In spite of the well understood role of secreted antimicrobial compounds and polypeptides at the cell boundary, the transport route from site of synthesis to the site of action is still a mystery. SNAREs are supposed to have a fundamental role in plant defense (Collins et al., 2003). Inactivation of allele AtSYP121 (encodes Qa- SNARE) and its ortholog HvROR2 in barley have high levels of host cell entry either by non-adapted fungal species or in the highly resistant barley mlo mutant allele (Assaad et al., 2004). Absence of the AtSYP121 gene results in a delay in the formation of localized cell wall appositions at attack sites of non-adapted powdery mildews, suggesting that AtSYP121 contributes to the timely establishment of pathogen-triggered cell wall reinforcements (Assaad et al
spinicuada Andes Ala Thr Asn Ala Ile Gly Ala Asp Ser Met 8 Anas f. flavirostris Ala Thr Asn Ala Ile Gly Ala Asp Ala Leu Anas f. oxyptera Ala Thr Asn Thr Ile Ser Ala Asp Ser Met Other Ducks Ala Thr Asn Ala Ile Gly Ala Asp Ala Leu High altitude species, subspecies, population, or allele = Seitse Andide partlast, kümme a/h polümorfismi, segregeeruvad vastavalt kõrgusele Ala9A, Thr78A, Glu96A, Ser117A, Met134A on evolutsioneerunud paralleelselt 24 eri liinis Thr112A ja Ser117A akodeeritakse küll eri kromosoomidel, kuid valgu tetrameeris on lähestikku (sama ka Thr6A Ala9A , ja Ser10A mis kõik ahelal).
Vastuseks tagandas Gregorius VII Heinrichile truud piiskopid, vabastas keisri alamad keisrile antud truudusevandest ja kuulutas ka tagandatuks Heinrichhi enese heites ta ka ühtlasi kirikust välja Suurem osa saksa ülikutest toetasid paavsti ning ähvardas juhul kui Heinrichpaavsti allele ei allu, valida uue keisri seda plaaniti teha Augsburgi kokkukutsutaval sinodil, kus paavst pidi olema eesistuja oma trooni säilitamiseks asus Heinrich teele paavst Gregorius VII poole 1077 jaanuaris astus Heinrich patukahetsejana paavsti ette Cannossa linnuses. pärimuse järgi seisis keiser 3 päeva paljajalu lumes paludes paavstilt armu.
Geneetlised põhjused, kasvav homosügootsus Looduslikud katastroofid 2. loeng (slaid) 8. Kohastumise mõiste Kohastumine on mitmeastmeline muutustega järkjärguline protsess, mis algab muutustega üksikute isendite nukleiinhapete struktuuris ning lõpeb populatsioonile, liigile või mõnele veelgi suuremale organismirühmale kasuliku omaduse kujunemisega 9. Geenitriivi mõju väikestele populatsioonidele osa allele võib lihtsalt "kaotsi minna", (väheneb geneetiline mitmekesisus?) 10. Geneetilise pudelikaela ja asutaja efekti mõisted 1-kui arvukuse languse järel jääb ellu üksnes väike osa isendeist. 2-populatsioon, mille asutas väike hulk isendeid, on väiksema mitmekesisusega, sest asutajad määravad sellesse sattunud geneetilised variandid 11. Loodusliku valiku mõiste Organismide ebavõrdne paljunemine ja ellujäämine , mis tuleneb nende geneetilistest ja elutingimuste iseärasustest 12
Saame teada kummaga on testpopulatsioon sarnasem. Näide: H1, H2 ja H3 märgivad 3 inimpopulatsiooni ning testi kasutatakse, et hinnata, kas andmed on kooskõlas nullhüpoteesiga (milleks on siis nt puu: ((H1, H2), H3), šimpans ning et pole toimunud geenivoolu H3 ja H1 vahel või H3 ja H2 vahel). Järgnevalt arvutatakse D statistiku väärtus: D = (nABBA-nBABA)/ (nABBA+nBABA), kus nABBA on saitide arv, kus H1 omab samu allele šimpansiga ja H2 ning H3 omavad erinevaid allele (ABBA saidid). nBABA on saitide arv, kus H2 omab samu allele šimpansiga ja H1 ning H3 omavad antud saitides erinevaid allele (BABA saidid) Kui D=0 (või on nulli lähedane), siis kehtib nullhüpotees, juhul kui on D erineb oluliselt 0-ist, siis on konstrueeritud nullhüpoteesi puu kas vale või on toimunud geenivool. 8. Mis on haplotüüpidel põhinevate meetodite nagu näiteks finestructure peamine eelis genotüübi
Kontrolltöö 1. 1. Milline järgnevatest vektorsüsteemidest kasutab peremeesrakku sisestatud DNA konstrukti tsirkulariseerimiseks cre rekombinaasi ? a) Plasmiid b) Mitte ükski c) Kosmiid d) YAC e) P1 2. Üheks väga levinud viisiks reaalaja kvantitatiivse PCR-i (qPCR-i) tegemisel on TaqMan proovide kasutamine. Millisel DNA polümeraasi omadusel, lisaks 5'-3' sünteesi aktiivsusele, põhineb antud tehnoloogia? a) DNA polümeraasi 3'-5' eksonukleaassel aktiivsusel b) DNA polümeraasi 5'-3' eksonukleaassel aktiivsusel c) DNA polümeraasi termostabiilsusel 3. Milliseid mehhanisme kasutatakse rakus geeniekspressiooni inhibeerimisel antisense DNA oligonukleotiididega? a) Moodustuva antisense oligonukleotiid/mRNA kompleksi katkilõikamine restriktsioonilise endonukleaasiga b) Translatsiooni blokeerimine oligonukleotiidi poolt c) DNA oligonukleotiid/mRNA kompleksi degradatsioon Dicer ensüü...
To a modern reader, d/d, b/b indicates lilac. This, as much as any visual similarity, helps explain why his Barrington Brown is so often confused with the dilute modifier. Shaw’s Chocolate alleles D+- = Normal colour (black/sepia) d/d = chocolate (in Shaw’ s words, Chocolate Dilution) Shaw’s Maltese alleles M+ = Dense colours e.g. black m/m = Maltese (or in our terms dilution) e.g. blue is the maltese of black Shaw's Barrington Brown allele B+ = Normal coat b/b = Barrington Brown Lilac (in Shaw's terminology) would be d/d, m/m = Dilution allele (chocolate) + Maltese allele = lilac. Lilac in modern terminology is b/b, d/d = Chocolate allele + dilution allele = lilac. Although there is no official modern symbol for the lost Barrington Brown, Ba is often used for convenience in modern discussion (since it isn't allocated to anything else). Brown Locus (modern symbols) B/- = Black/Brown (Shaw's black/sepia)
absolute or relative quantity they possess within the genome) in Sponges containing gemmules were collected manually from order to assess their importance (representability). shallow depths (up to 0.5 m) from 6 sites in Estonian rivers and Previously described methods that employ PCR and direct streams from 3 drainage basins (see [7]) the Peipsi-Pihkva Lake sequencing for determining allele frequencies in pooled DNA and the Narva River drainage basin: River Piusa (specimen Pi) and PLOS ONE | www.plosone.org 1 June 2013 | Volume 8 | Issue 6 | e66601 Intragenomic Profiling Using Multicopy Genes
sageli kromosoomideks. tsentromeer (ingl. Centromere)- Koht, kus kaks tütarkromatiidi on teineteisega seotud. Tsentromeeri piirkonda tekib ka kinetohoorne kompleks, kuhu raku jagunemisel seostuvad kääviniidid. telomeer (ingl. Telomere)- Eukarüootsete kromosoomide otstes paiknev unikaalne struktuur, mis ei lase kromosoomidel omavahel ühineda ega kromosoomi otste geenidel mitooside käigus degradeeruda. alleel (allelomorf; ingl. Allele (Allelomorph))- Kromosoomi lookuses olev üks kahest või mitmest alternatiivsest geeniteisendist, mis tähistatakse sama põhisümboliga (nt. alleelid a+ ja a). 2. Homoloogilised kromosoomid, tütarkromatiidid homoloogsed kromosoomid (ingl. Homologous chromosomes)- Paarilised kromosoomid liigi kromosoomistikus, mis on oma suuruselt, kujult ja geenidelt sarnased. Üks homoloogidest on pärit isalt, teine emalt. tütarkromatiid e
fenotüüpide ettearvamise meetodit 11 2. Massvalik – ristamiseks valitakse vanemate hulgast välja kindlate omadustega väike grupp isendeid. Inbriiding – lähedalt suguluses olevate isendite ristumine. Järglaskonnas suureneb homosügootide aste, lähisugulaste lastel on suurem risk geneetilistele haigustele. Nt on inbriidingu efekt albinism, ehk pigmendi puudumine. Pigmendi puudumise oõhjustav allele sattus sugulusabielude tõttu homosügootsesse olekusse. 16. Sugukromosoomid erinevatel organismidel. Eksperimentaalsed tõendid selle kohta, et pärilikkus on seotud kromosoomidega. Homogameetne sugupool – moodustab sugukromosoomide osas ühesuguseid sugurakke (gameete) Naised XX, sugurakus lisaks autosoomidele X kromosoom Heterogameetne sugupool – moodustab sugukromosoomide osas erinevaid sugurakke Mehed XY, sugurakus lisaks autosoomidele kas X või Y kromosoom
less tender than that from NN pigs; the Nn al. 2006). Chromosome 2 region 60–66 cM pigs were intermediate. appears to be associated with all measures of Meat from pigs (Swedish Hampshire x pork tenderness and the region on chromo- Finnish Landrace) that are homozygous some 17 (32–39 cM) was associated with and heterozygous for the rendement napole measures of intramuscular fat and loineye (RN-; acid meat) allele has been shown to be area. juicier than that from noncarriers. The RN- allele also contributes to tenderness (Josell et Diet Effects on Meat Quality al. 2003). Emnett (1999) reported that Berkshire and Chester White pigs had lower Diet can contribute to meat quality directly glycolytic potential (thought to be an indica- (compounds from the feed source deposit in
are stabilized by actin-binding proteins. One actin-binding protein called alpha-actinin 3 (ACTN3) is expressed only in fast-twitch muscle ber, the crown jewel of shot-putters and bodybuilders worldwide. It turns out that both of my chromosomes (one from Mammy and one from Pappy Ferriss) contain the R577X variant of the ACTN3 gene, a mutation that results in a complete de ciency of our most desired ACTN3. This variant, amusingly called a "nonsense allele," is found in more than a billion humans worldwide. Sad Christmas. The cover letter from Gist Sports began with the following headline, which, in good humor, lacks an exclamation point: Congratulations Tim Ferriss. Your Genetic Advantage: Endurance Sports. This is a diplomatic way of telling me (1) I'm not likely to win an Olympic gold medal in sprinting, and (2) I am not genetically pre-programmed to gain a lot of muscular mass.
annaabi.ee 
Sisene Facebook'ga
Sisene Google'ga
Sisene LinkedIn'ga
