Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
bioloogilist funktsiooni, kuna e-väärtused on juba liiga suured ning
kokkulangevus oli juhuslik.
phosphopyruvate hydratase E=3.6 Score=32.5
2-phospho-D-glycerate hydrolase [Nereis macrydi] E=6.5 Score=31.6
c. Võrdle antud programmi standardparameetrite (filtrid, expect, sõna pikkus,
maatriksi tüüp, tühiku skoorid) väärtuseid eelmises ülesandes kasutatud
programmi standardparameetrite väärtustega. Kasutades juhendeid, tutoriale,
abidokumente jne, selgitada nende väärtuste erinevuste põhjused miks on
teatud väärtused sobivad täieliku pikkusega valgujärjestuste jaoks ja miks
teatud väärtused motiivide otsingutel.
Parameetrid Short sequence program Protein-protein BLAST
(blastp)
Filter Ei ole filtrit Low-complexity