Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
SEIVVSKFGGTSVADFDAMNRSADIVLSDANVRLVVLS
Sbjct 1 SEIVVSKFGGTSVADFDAMNRSADIVLSDANVRLVVLS 38
Coli järjestused on kõige sarnasemad, kuid sarnane järjestus leiti ka näiteks järgnevates
organismides:
Shigella
Salmonella
Klebsiella
c.Identifitseerida valgud kasutades DNA transleerimist kõigis 6-s raamis ning otsingut
transleeritud järjestuste andmebaasist.
gb|CP000948.1| Escherichia coli DH10B, complete genome
Length=4686137
Features in this part of subject sequence:
aspartokinase III
glucosephosphate isomerase
Score = 647 bits (1406), Expect = 0.0
Identities = 268/268 (100%), Positives = 268/268 (100%), Gaps = 0/268 (0%)
Frame = +2/+3
Query 2
REDN*THVGIRKHNISAAVHGVKISYAGTAKFGDNNFRHNYLVSGDPFSALAQGKSGRRV 181
REDN*THVGIRKHNISAAVHGVKISYAGTAKFGDNNFRHNYLVSGDPFSALAQGKSGRR
V
Sbjct 4330836
REDN*THVGIRKHNISAAVHGVKISYAGTAKFGDNNFRHNYLVSGDPFSALAQGKSGRRV 4331015
Query 182