Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
organismidega.
e. Uurida taksonoomia raportit iga valgu jaoks eraldi (vajaduse korral analüüsida
järjestust mitmes osas) leida kõige sarnasemad järjestused järgmistele
taksonoomilistele rühmadele. Märkida ära skoor, E väärtus, liik (juhul, kui
tulemusi ei leita, muuta otsingu parameetreid NCBI juhendid).
i. Viirused
Vastus:
gi|39163649|ref|NP_945128.1|
replicase [Johnsongrass chlorotic stripe mosaic virus] 31.6 11
ii. Archaea
Vastus:
gi|118753375|ref|ZP_01601187.1|
Triose-phosphate isomerase [Metallosphaera sedula DSM 5348] 55.1 3e-07
iii. Bacteria
Vastus:
gi|15804508|ref|NP_290548.1|
triosephosphate isomerase [Escherichia coli O157:H7 EDL933] 498 2e-139
iv. Fungi
Vastus:
gi|50424135|ref|XP_460653.1|