Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
an alignment, introduction of a gap causes the deduction of a fixed amount (the
gap score) from the alignment score. Extension of the gap to encompass additional
nucleotides or amino acid is also penalized in the scoring of an alignment.
d. Varieerida parameetreid ükshaaval, selgitada nende mõju tulemustele:
Mõju avaldas parameetrite muutmine vaid skoorile, expect ei muutunud.
i. Leida skoor ja E järjestuse gi|21325986|gb|AAM47554.1| jaoks
järgmistel parameetrite kombinatsioonidel:
>gi|21325986|gb|AAM47554.1|AF428108_1 alpha-enolase [Crocodylus palustris]
MSVLKVHAREIFDSRGNPTVEVDLYTNKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRFMGKGVSKAVEHVN
KTIAPALISKNINVVEQEKIDRLMLEMDGSENKSKFGANAILGVSLAVCKAGAAEKGVPLYRHIADLAGN
SEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAESFKEAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDE
GGFAPNILENKEALELLKNAINKAGYSDKIVIGMDVAASEFYRDGKYDLDFKSPDDPSRYITHDQLGDLY
annaabi.ee 
