Genoomi struktuur ja funktsioon
Nad
seovad küpse miRNA ja orienteerivad seda interaktsiooniks märklaud mRNAga.
•
• MikroRNAde geenid
• miRNAde geenid paiknevad genoomis kas:
– Eraldi geenidena
– Geeniklastritena ja transkribeeritakse polütsistroonse primaarse
transkriptina mis lõigatakse mitmeteks miRNAdeks.
– Valke kodeerivate geenide intronites ja transkribeeritakse kodeeriva geeniga
samalt ahelalt kui ka vastasahelalt. Kui miRNA on orienteeritud samas
suunas kui ümbritsev geen, transkribeeritakse see juhuslikult koos
peremeesgeeniga ja lõigatakse splaissimisel suuremast transkriptist, kus nad
ennast peidavad.
– Või ka mittekodeerivate geenide eksonites
• miRNA transkriptsiooni viib läbi enamasti RNAP II, kuid harvemini ka
RNAP III.
•
• MikroRNAde seondumiskohad – paiknemine, omadused, ennustamine