Praktiline töö - SDS-PAGE PROTEOOMIKA
polüpeptiidide molekulmasside alusel.
SDS-PAGE abil valkude eraldamist saab kasutada: valkude suhteliste molekulmasside
hindamiseks, valkude sisalduse määramiseks proovis, valguproovide puhtuse hindamiseks,
valkude puhastamise ja fraktsioneerimise jälgimiseks.
Denaturatsiooniks kasutatav detergent SDS lagundab natiivseid valke, lõhkudes valkudel nii
sekundaar- ja tertsiaarstruktuuri kui ka kvarternaarstruktuuri.
Polüpeptiidide omavaheline kovalentne seondumine vähendab valguproovi analüüsi täpsust,
kuna sama molekulmassiga bändid võivad sisaldada ühte polüpeptiidi või dimeeri/terrameeri.
Taolise probleemi ärahoidmiseks kasutatakse proovi ettevalmistamise käigus redutseerivat
agenti dithiothreitol (DTT või Clealand`i reagent) või 2-merkaptoetanooli (2-ME).
Redutseerivates tingimustes lagunevad disulfiidsidemed ning disulfiidseotud valkude
oligomeerid algunevad.
„Plaat” geeli vorm koosneb kahest paralleelsest klaasplaadist või plastiklehest, mille vahele
annaabi.ee 
