"trifosfotaasi" - 1 õppematerjal

Grupp III dsRNA viirused

1-ja 2-valgud on RNAd siduvad valgud ning kontakteeruvad viiruse genoomiga. Peale nende leidub sisemises kapsiidis veel kaks minoorset valku, 3 (12 koopiat) ja µ2 (12 kuni 24 koopiat). Minoorsed valgud paiknevad sisemise kapsiidi siseküljel (five fold teljel?). Sisemine kapsiid ei sisalda kanaleid (v.a. five-fold telgede tippudes) ja kaitseb genoomi väliskeskkonna mõjude eest. Core struktuur on ensümaatiliselt aktiivne ja sisaldab RdRp (polümeraasi), RNA trifosfotaasi ja guanülüültransferaasi aktiivsusi ning kahte tüüpi metüültransferaasi (metüleerivad vastavalt G jääki cap struktuuris ja RNA esimese nukleotiidi riboosi 2'-O positsioonis). Peale valkude ja genoomse dsRNA leidub virionides veel kahte tüüpi RNA oligonukleotiide: ca. 2400 koopiat nukleotiidi GC(U)(A) (2-9 nukleotiidi pikkune), mis kujutavad endast abortatiivse transkriptsiooni produkte. Umbes 10% seda tüüpi oligonukleotiididest on capeeritud;