Mõjutavad geeniekspressiooni translatsiooni tasemel - seondudes mRNA molekulile, põhjustavad mRNA translatsiooni represseerimist.miRNA võib olla seondunud mitme erineva mRNA-ga, sest seondumisel ei pea RNAd olema täielikult homoloogsed nagu seda siRNAde korral. NB! miRNA on endogeense päritoluga 10. Nimeta RNA alatüübid ja nende olulisemad funktsioonid? 1. Kodeeriv RNA ehk mRNA , mis transleeritakse valgujärjestuseks . 2. Mittekodeeriv RNA ehk ncRNA, mida ei transleerita valguks. snoRNA- osalevad rRNA, snRNA, tRNA keemilises modifitseerimises ja protsessingus. snoRNA geenid asuvad rRNA geenide intronites. snoRNA moodustab komplekse valkudega snoRNP. Otsmised pöördkordusjärjestused (nt IS elemendil)- mõlemas otsas on IR järjestused (inverted repeat) ehk 9 50 bp otsmised pöördkordusjärjestused (vastassuunalised, palindroomsed). Järjestused, mis on ühesugused 5' 3' suunas lugedes
Liidese operatsioonide näitamiseks spetsifitseeritakse liides klassina koos stereotüübiga “interface”, kasutades tavalist klassisümbolit. Pärimisseost liideste vahel saab näidata klassidiagrammil, kus kõik liidesed omavad stereotüüpi “interface”. Paketid Pakett on mudelielementide grupeerimise mehhanism. Kõiki mudelielemente, mida pakett omab või millele ta viitab, nimetatakse paketi sisuks. Paketi eksemplar ei oma mõtet. Pakette kasutatakse modelleerimistöös ega transleerita täidetavateks süsteemideks. Mudelielemendi omanikuks ei saa olla rohkem kui üks pakett. Paketti nimetatakse sageli allsüsteemiks. Paketid võivad importida mudelielemente teistest pakettidest. Kui element on imporditud paketi poolt, siis see pakett viitab talle justkui omanikpakett. Pakettide vahel on lubatud sõltuvusseosed, peenendusseosed ning üldistusseosed. Pakett esitatakse suure ristkülikuna koos väikese ristkülikuga vasakus ülanurgas
sidumisega enhanceritele. Enamusel juhtudest see sidumine represseerib translatsiooni. Valkudel, millel selline repressioon esineb, on kirjeldatud tsütoplasmaatilist polüadenüülimist, mis peab sellisele repressiooni mehhanismile eelnema. Tsütoplasmaatiline polüadenüülimine on varases embrüos üks olulisimaid geeniregulatsiooni teid. Hulkraksete munarakud sisaldab paljude valkude mRNAsid, mida enne ei transleerita, kui alles pärast munaraku viljastamist. Mõnedel neist "ladustatud" mRNAdest on lühike polü(A) saba, koosnedes vaid 20-40 A jäägist. See tähendab, et vaid üksikud polü(A)ga-seonduvad PABPI valgud savad selliste sabadega seostuda ja neid stabiliseerida. Kuna lühikese polü(A) saba stabilisatsiooni ei toimu, siis neid mRNAsid efektiivselt ei transleerita. Teatud munaraku arengustaadiumis või koheselt pärast viljastumist,
tulemusel. Giid RNA vaba 3'-OH ots atakeerib pre-mRNA estersidet ja seondub kovalentselt pre- mRNA 5' otsa. Vana pre-mRNA 3'-OH ots atakeerib kahe kõrvutioleva lõpmise U vahelist sidet giid RNA-s. Tulemuseks on ühe U lisandumine pre-mRNAsse (korrigeeritud mRNA). Giid RNAd transkribeeritakse mitokondri kindlalt geenilt. Osaliselt komplementaarsed pre-mRNAga. Antisens RNA - RNA osad, mis reguleerivad geenide avaldumise aktiivsust. Antisens RNA-d ei transleerita. On transkribeeritud DNA antisens ahelalt. On komplementaarne transleeritava mRNA- ga. Môlemad RNA-d koos vôivad moodustada dupleksi ja inhibeerida valkude sünteesi. mRNA sünteesitakse vaid ühe DNA ahela (matriitsahela) põhjal, mida nim. ka RNA mõtteliseks ahelaks (sense strands). Teine DNA ahel on mittematriitsahel, millelt sünteesitakse antisens RNA (mittemõtteline) - mittekodeeriv. 119. RNA korrektsioon. mRNA posttranskriptsiooniline informatsiooni muutmine enne translatsiooni.
Mõlemad protsessid võivad toimuda üheaegselt. mRNA transpordi kontroll: Eukarüoodil reguleeritakse mRNA transporti tuumast tsütoplasmasse. Eksperimendid näitavad, et peaaegu pooled tuumas sünteesitud transkriptid ei jõua sealt välja ja degradeeritaksegi tuumas. Küps mRNAs läheb tsütoplasmasse läbi tuumamembraanisolevate pooride. mRNA kontroll translatsioonil: Heaks näiteks on viljastamata munarakk, milles mRNA-d küll sünteesitakse ja säilitatakse, kuid ei transleerita. Intensiivne translatsioon algab kohe pärast viljastamist. Taoline säilitatav mRNA on kaetud vastavate valkudega, mis kaitsevad seda degradatsiooni eest ja inhibeerivad translatsiooni. Polü(A) terminaalne järjestus viib translatsioonile. Säilitatud mRNAs on polü(A) väga lühike. Aktivatsioon toimub siis kui ensüüm tunneb ära AU-rikkad elemendid ja lisab nendele ~150 A nukleotiidi, et moodustuks täielik polü(A) terminus .
Initsiatoorne tRNA – metionüül-tRNA, ei Metionüül-tRNA, formüleeritakse formüleerita mRNA on monotsistoorne ja kodeerib vaid mRNA on polütsistoorne ja kodeerib mitut ühte valku, üks ORF erinevat valku (mitu ORFi – lugemisraami) mRNA 5’otsa lisatakse m7G cap struktuur Ei esine cap struktuuri (m7GpppNpNpN). m7G cap on mRNA-ga Ühendatud 5’-5’ sidemega. Seega on mRNA-l Kaks 3’ otsa, algne 5’ ots on cap struktuuriga Peidetud. 5’UTR ei transleerita mRNA 3’ otsas on kuni 200 nukleotiidi pikkune polü (A) järjestus, mis lisatakse mRNA 3’ (mittetransleerivas osas) paiknevale polü (A) Signaaljärjestusele AAUAAA mRNA initsiaator- AUG on raamistatudKozak’i konsensusele sarnane Shine Dalgarno spetsiifilise kontekstjärjestusega A/GNNAUGG järjestus - Kozak’i konsensus – soodustab translatsiooni initsiatsiooni mRNA süntees tuumas, translatsioon Ühe mRNA transkriptsioon ja translatsioon
koodon. Sellest 7 nukleotiidi ülespoole jääb polüpuriinjärjestus konsensusega AGGAGG. See järjestus on komplementaarne ribosoomi 16S rRNA 3´-otsa lähedal paikneva nukleotiidse järjestusega (paardub sellega), mistõttu seda mRNA järjestust nimetatakse kas RBS-ks (ribosome binding site) või Shine-Dalgarno järjestuseks (nimetatud teadlaste järgi, kes selle mehhanismi avastasid). Shine-Dalgarno järjestuse puudumisel mRNA-d ei transleerita või transleeritakse väga vähe. Ribosoomi 30S subühik ja mRNA moodustavad kompleksi ainult IF3 juuresolekul. Polüpeptiidi sünteesi initsiatsioonil osaleb spetsiaalne tRNA molekul metionüül-tRNA fMet, mis tunneb ära translatsiooni initsiaatorkoodoni AUG (harva on selleks GUG, mis mRNA muudes positsioonides kodeerib valiini) ja viib ribosoomi formüülmetioniini (metioniini, mille aminorühm on blokeeritud formüülrühmaga).
koodon. Sellest 7 nukleotiidi ülespoole jääb polüpuriinjärjestus konsensusega AGGAGG. See järjestus on komplementaarne ribosoomi 16S rRNA 3´-otsa lähedal paikneva nukleotiidse järjestusega (paardub sellega), mistõttu seda mRNA järjestust nimetatakse kas RBS-ks (ribosome binding site) või Shine-Dalgarno järjestuseks (nimetatud teadlaste järgi, kes selle mehhanismi avastasid). Shine-Dalgarno järjestuse puudumisel mRNA-d ei transleerita või transleeritakse väga vähe. Ribosoomi 30S subühik ja mRNA moodustavad kompleksi ainult IF3 juuresolekul. Polüpeptiidi sünteesi initsiatsioonil osaleb spetsiaalne tRNA molekul metionüül-tRNA fMet, mis tunneb ära translatsiooni initsiaatorkoodoni AUG (harva on selleks GUG, mis mRNA muudes positsioonides kodeerib valiini) ja viib ribosoomi formüülmetioniini (metioniini, mille aminorühm on blokeeritud formüülrühmaga).
-sõltumatu terminatsioon. Rho faktorist sõltumatu terminatsioon toimub juuksenõela struktuuri abil. GC-rikkad kordusjärjestused tekitavad RNA-l stabiilseid juuksenõelastruktuure, mis seonduvad RNAP-ga ning destabiliseerivad kolmikkompleksi. Termineerumist soodustab GC-korduste järel olev T-rikas piirkond, mis vastab RNA-l U-rikkale järjestusele, mis soodustab kolmikkompleksi lagunemist. Rho-sõltuv terminatsioon toimub tavaliselt RNA-l, mida ei transleerita. Rho seondub RNA-l rut (inglise keeles rho utilization site) järjestusele, mis on C-rikas, ning kasutades ATP-d liigub mööda RNA-d polümeraasile järele, seondub RNAP-ga ning põhjustab kolmikkompleksi lagunemise (DNA-RNA kompleksi). RNAP jääb tavaliselt u 100 bp pärast rut järjestust toppama spetsiifilisel terminatsioonijärjestusel ning ,,ootab" Rho-faktorit järele. Mõnikord ei saa polütsistroonselt RNA-lt operoni esimest geeni transleerida ning Rho faktor
annaabi.ee 
