Translatsioonil kulutatakse GTP energiat. Kuna ppGpp on sünteesitud GTP-st, langeb rakkudes GTP kontsentratsioon ja ka see võib hakata translatsiooni piirama. 5. Selgitage geeniregulatsiooni mehhanisme, mida võimaldab transkriptsiooni ja translatsiooni samaaegne toimumine bakterirakus? Transkriptsiooni regulatsioon Parasjagu sünteesitavalt mRNA-lt algab kohe ka translatsioon. Nende kahe protsessi praktiliselt samaaegne toimumine võimaldab reguleerida transkriptsiooni termineerumist transkriptsiooni ja translatsiooni elongatsiooni kiiruste kaudu. Regulatsioon toimub spetsiifilistelt liiderjärjestustelt, millel on potentsiaal moodustada RNA sekundaarstruktuure ning sellesse ei ole kaasatud regulaatorvalke. Transkriptsiooni attenuatsioonil osalevad nii rho-sõltuvad kui ka rho-sõltumatud terminaatorid. Regulatsiooni transkriptsiooni attenuatsiooni kaudu on kirjeldatud näiteks aminohapete biosünteesi
Terminatsioon toimub pärast U- de lülitumist. Juuksenõela moodustumine viib RNA:DNA hübriidi lahutamisele U-rikkast järjestusest. rU::dA RNA-DNA hübriid võib olla piisavalt ebastabiilne, et RNA vabaneks transkriptsioonikompleksist. Sellised terminaatorsignaalid paiknevad sageli operonide lõpus mittetransleeritavates järjestustes pärast stop koodoneid (näiteks trp operoni lõpus). Mittetransleeritavate RNA-de (rRNA ja tRNA) transkriptsiooni peatumist või termineerumist soodustavad nendele molekulidele iseloomulikud sekundaarstruktuurid. Selleks, et vastavaid geene siiski transkribeeritaks, vajatakse spetsiaalseid antiterminatsiooni faktoreid nagu näiteks Nus valk (N-utilization, kirjeldatud esmalt faag lambda puhul) ja ribosoomi valk S10. Transkriptsiooni attenuatsioon Bakteritel on transkriptsioon ja translatsioon omavahel väga tihedalt seotud: parasjagu sünteesitavalt mRNA-lt algab kohe ka translatsioon
Sellest johtuvalt on RNAP ees positiivne superspiralisatsioon, mida güraas leevendab. RNAP taga on negatiivne superspiralisatsioon, mida TopA leevendab. Transkriptsiooni terminatsioon saab toimuda kahel viisil: Rho-sõltuv ja -sõltumatu terminatsioon. Rho faktorist sõltumatu terminatsioon toimub juuksenõela struktuuri abil. GC-rikkad kordusjärjestused tekitavad RNA-l stabiilseid juuksenõelastruktuure, mis seonduvad RNAP-ga ning destabiliseerivad kolmikkompleksi. Termineerumist soodustab GC-korduste järel olev T-rikas piirkond, mis vastab RNA-l U-rikkale järjestusele, mis soodustab kolmikkompleksi lagunemist. Rho-sõltuv terminatsioon toimub tavaliselt RNA-l, mida ei transleerita. Rho seondub RNA-l rut (inglise keeles rho utilization site) järjestusele, mis on C-rikas, ning kasutades ATP-d liigub mööda RNA-d polümeraasile järele, seondub RNAP-ga ning põhjustab kolmikkompleksi lagunemise (DNA-RNA kompleksi). RNAP jääb
annaabi.ee 
