Nüüd siseneb kompleksi ribosoomi suur subühik ja algab valgusüntees nagu eelkirjeldatud. /faktorid, mis suunavad mRNA'd läbi ribosoomi kutsutakse translatsiooni ejakulatsioonifaktoriteks/. Süntees lõpetamiseks on vaja stoppkoodonit (UAG, UAA või UGA), millele ei vasta ühtegi aminohapet, seega pole ka vastavat tRNA'd. Kui ribosoomi A-saiti satub stoppkoodon, siis süntees peatub ja ribosoomi sattub tRNA'le sarnane valgu molekul terminatsioonifaktor (release factor). Kuna mRNA edasiliigutamise vältimatuks eelduseks on peptiidsideme teke ja seda enam saavutada võimalik ei ole, siis ribosoom lihtsalt laguneb, kuna ei suuda oma funktsiooni enam täita. Valgusüntees on lõppenud. Ühte ja seda sama mRNA'd kasutavad mitu ribosoomi. 08/10/09 /.../Kuidas ikkagi elu tekkis? Meil on viirused, mis talletavad pärilikkusinfot RNA'l. See viitab sellele, et kunagi koosnes elu RNA ja valgu molekulidest
Terminatsioonifaktori esinemisel A-saidis muudetakse peptidüüli transferraarset aktiivsust nii, et ta lisab moodustuva polüpeptiidahela viimase aminohappe karboksüülotsa veemolekuli. Reakstiooni tulemusel vabaneb polüpeptiid tRNA molekulist. Terminatsioon lõpeb mRNA molekuli vabanemisega ribosoomist ja ribosoomi dissotsiatsiooniga alaüksusteks, mida katalüüsib ribosoomi vabanemisfaktor RRF (teise klassi terminatsioonifaktor, ei tunne terminatsioonikoodoneid iseseisvalt ära). (A-sait- ribosoomi piirkond, mis on hõivatud aminoatsüül-tRNA poolt) 21. Geeniekspressiooni regulatsioon. Multirakulise organismi moodustumiseks on vaja, et konkreetsed geenid avalduksid õigel ajal ja õiges kohas, st peab toimima geenide ajaline ja ruumiline regulatsioon. Eukarüootide geeniekspressiooni reguleeritakse kolmel tasandil: Transkriptsioonil- transkriptsioonifaktorid, eukarüootsetel rakkudel peab
Koodonikasutamise indeksid (CAI - codon adaptation index) Programmeeritud raaminihe (RF2, retroviirused) Cai – igale koodonile antakse arvuline väärtus vastavalt tema esinemisele sagedastes valkudes. Kõige kasutatavam koodon saab väärtuse 1, teiste kasutatavus arvutatakse selle järgi. kõigi alternatiivsete koodonite kasutuse hulgast võetakse geomeetriline keskmine, mis ongi CAI. Terminatsioonifaktor II (RF II) tunneb ära UGA koodoni. Kui RF II-te on rakus vähe, siis toimub +1 raaminihe ja sünteesitakse RF II-te juurde. Enne seda on SD järjestus, et ribosoom oleks veits aeglasem. HIVis kapsiidi ja polümeraasi valgud kattuvad, aga kapsiidi on vaja umbes 100 korda rohkem. Transkribeeritakse üks mRNA. Enamus ribosoome transleerib kapsiidivalgu. Aga mõni ribosoom nihkub ühe nukleotiidi võrra tagasi (-1 raaminihe) ja terminatsioonikoodonit enam
Rakkudes vajalik protsess. Mõnede valkude pikemad vormid omavad kindlat regulatoorset tähtsust. UAA on kõige tugevam stoppkoodon ja selle koodoni kohale AH ei lülitata. prokarüoodid eukarüoodid RF-1 – UAG eRF-1 tunneb kõik ära RF-2 – UGA klass I RF-1 ja 2 – UAA 29 klass II RF-3 eRF-3 Terminatsioonifaktor seostub samasse kohta kui tRNA, on ribosoomisõltuv. Kogu translatsiooniprotsessi käigus on seondunud alati 2 tRNA-d korraga. Kui A-saiti jõuab üks kolmest stoppkoodonist, seostub RF-1 või 2 olenevalt koodonist. RF-3 seostub GDP-ga RF-1-le, koos GGQ-ga (RF-1-ga seotud) vabastab valguahela. Ehk siis klass II faktorit vaja, et lahti lasta. RF-3 tuleb ja laseb lahti. Klass I tunneb ära, klass II aitab lõpuni viia. RF-3 seondub ribosoomiga GDP vormis – erandlik. RF-3
ühinemist. eIF6 (25 kDa) Seob 60S alaühikut, põhiline antiassotsiatsioonifaktor. Elongatsioonifaktorid eEF1 (3 alaühikut: 51 kDa, 48 kDa ja 35 kDa). Seob GTP-sõltuvalt aa-tRNA-d, omab ka GDP-GTP vahetusaktiivsust. Seega EF-Tu ja EF-Ts analoog. eEF2 (95 kDa). Bakteri EF-G analoog, translokatsiooni faktor. eEF3 (125 kDa). Ainult pärmis, katalüüsib tRNA dissotsatsiooni ribosoomi E-saidist. On ribosoomist sõltuv GTPaas ja ATPaas. Eukarüootides on leitud üks universaalne terminatsioonifaktor: eRF (54 kDa dimeer). Põhjustab terminatsioonikoodonist sõltuvat valgusünteesi terminatsiooni. Kuna eukarüootide valgusünteesi terminatsiooni on seni suhteliselt vähe uuritud, siis on tõenäoline, et on veel avastamata terminatsioonifaktoreid (näiteks prokarüootse RRF'i analoog). On leitud eukarüootseid mRNA-sid kus 5´cap-i ja valku kodeeriva lugemisraami vahel on tuhandeid nukleotiide. Need mRNA-d sisaldavad oma 5´-mittekodeerivas osas