Järjestuste võrdlemine, otsingud andmebaasidest (BLAST, FASTA, SW).
enterica serovar Newport str. SL317]
ref|ZP_02833567.1| hypothetical protein Salentericaenterica_19432
[Salmonella enterica
subsp. enterica serovar Weltevreden str. HI_N05-537]
Length=255
Järgnevatel valkudel oli vastavus juba madalam, kuna tegemist on erinevate
organismidega.
e. Uurida taksonoomia raportit iga valgu jaoks eraldi (vajaduse korral analüüsida
järjestust mitmes osas) leida kõige sarnasemad järjestused järgmistele
taksonoomilistele rühmadele. Märkida ära skoor, E väärtus, liik (juhul, kui
tulemusi ei leita, muuta otsingu parameetreid NCBI juhendid).
i. Viirused
Vastus:
gi|39163649|ref|NP_945128.1|
replicase [Johnsongrass chlorotic stripe mosaic virus] 31.6 11
ii. Archaea
Vastus:
gi|118753375|ref|ZP_01601187.1|
Triose-phosphate isomerase [Metallosphaera sedula DSM 5348] 55.1 3e-07
iii. Bacteria
Vastus: