Molekulaarbioloogia
Transkriptsiooni initsiatsiooni eeltuumsetes määrab sigmafaktor ära ahela spetsiifika.
Kahte ahelat nimetatakse erinevat moodi. Ahel, mis on identse nukleotiidilise
järjestusega mRNAle, nim + ahel – kodeeriv ahel. Teine on mRNA-le
komplementaarne ahel 3’→ 5’ suunas. RNA-d sünteesitakse ju 3’ →5’ suunas.
Sigmafaktor tagab seondumisel ühelt poolt seondumisjärjestuse spetsiifika ja
kompleksi avatuse, teiselt poolt RNA polümeraasi vaheldumise. Koos sigmafaktoriga
toimub promootori äratundmine, see on kiire protsess, toimub millisekunditega. Kui
elongatsioon on alanud, siis toimub kiiresti. Promootorpiirkond vabaneb 1-2 sekundi
jooksul.
45
Sigmafaktor tunneb ära kindla heksameeri ja määrab ära, mille pealt süntees toimub.
Kahte ahelat nimetatakse + ja -. See ahel, mis on identse nukleotiidilise järjestusega
kui sünteesitav mRNA on + ahel – kodeeriv ahel. – ahel on komplementaarne ahel,