2. Aminoglükosiidide > tekivad hälbega 1. Naturaalsed ensümaatiline modifikatsioon (geenid nii 1. Aminoglükosiidid peptiidahelad. NB!!! Sünergistlik kromosoomis kui ka plasmiidides > kerge üle toime -laktaamide ja kanda). 3. Ribosoomi seostumiskohtade glükopeptiididega (hrl modifikatsioon. 4. Rakumembraani kombineeritud ravi). läbilaskvuse vähenemine. 5. Aktiivne väljapumpamine.
Andmete eeltöötlus ja normaliseerimine: -Filtreerimine: müra (taustsignaal) kõrvaldamine? Madala intensiivsusega signaalid (spots)? Küllastunud signaalid? Madala kvaliteediga signaalid (ghosts spots, tolmu spots etc). -Ekstreemsed proovid? -Koduhoidjad (housekeeping) geenid = kontrollgeenid -Intensiivsusest sõltuv (tavalisene): globaalset intensiivsust või globaalset suhet kasutades arvutatakse üks normaliseerimifaktor Mikrokiipidel põhinevad valk-DNA seostumiskohtade uuringud: -Kaardistamine kasutades kromatiini immunopretsipitatsioonitehnikaid ja kiipe. -----Valgud ristseotakse (crosslinking) genoomsele DNA-le in vivo. -----DNA lõigatakse ensüümidega või mehhaniliselt -----DNA-valk kompleksid immunopretsipiteeritakse -----Eri allikatest pärit (kotroll ja test DNA) kompleksidega seostatakse linkerid ja amplifitseeritakse ning märgistatakse erinevate värvidega -----Tulem hübridiseeritakse kiipidele
rakus. Ensüümiga seotud retseptorid – nende tsütoplasmaatiline osa on kas ensümaatiliste omadustega või otseselt seotud mõne ensüümiga. Türosiinkinaasne domeen fosforüülib retseptori tsütosoolipoolse osa türosiini kõrvalahelad Retseptor-türosiinkinaaside aktiveerumine dimeriseerumise kaudu. Signaal valk kinnitub insuliini retseptorile, transautofosforüülimine aktiveerib kinaasseid domeene, transautofosforüülimine kutsub esile signaliseerivate valkude seostumiskohtade paljastumise, signaliseerivate valkude aktiveerumine ja signaalide allavoolu liikumine Tütokiinide poolt aktiveeritava JAK-STAT signaliseerimise raja toimimise põhimõte. (Näide türosiin-kinaas seotud retseptorist) Tsütokiini retseptoridele kinnitub tsütokiin, retseptori küljes olevad valgud fosforüülivad teineteist ja aktiveeruvad. JAKvalgud fosforüülivas retseptorit (STAT valke). STAT valgud eralduvad ja tekitavad transkriptsiooni regulatsiooni kompleksi ning kinnituvad cis
protsessiivsusfaktor, sest selle puudumisel pole ensüüm protsessiivne. Punktiirjoon natiivselt arvatakse, et on sealt ühendatud, aga kristallstruktuuris ei paista välja. suletud sümmeertilised struktuurid ehk torroidid ümbritseb täielikult substraati, dissotsieerumise tõenäosus väike. Ensüümid on pm lõpmatu protsessiivsusega, liiguvad niikaua, kuni töö on tehtud. 2. rea polümeeri kordusühikute seostumiskohtade esinemine polümeeriga interakteerutakse läbi mitme monomeeri ühiku. Kui üks interaktsioon katkeb, siis ensüüm ei dissotsieeru kohe. Protsessiivsuseks on vajalik, et oleks substraadi küljes kõvasti küll kinni, aga pärast katalüüsi akti on vaja edasi liikuda. See saavutatakse siis, kui on rida nõrku interaktsioone (mitte paar tugevat interaktsiooni). Ensüümid, mis
annaabi.ee 
