Imputeerimine
Flow-cell põhjas on
lühikesed oligonukleotiidi järjestused, mis on komplementaarsed
DNAle liidetud adapteritega. DNA denatureeritakse üheahelaliseks
ning liidetakse flow-celli põhjas olevatele oligonukleotiididele.
Toimub sildamplifikatsiooni teke, mille tulemusel tekivad identsed
DNA klastrid. Peale amplifikatsiooni DNA fragmendid
denatureeritaske ja komplementaarsed ahelad pestakse, nii et järgi
jäävad vaid ühest otsast kinnitatud DNA üksikahelad. Neile lisatakse
sekveneerimispraimerid mis on komplementaarsed DNA otsas
olevate oligonukleotiididega. Nüüd on DNA valmis
sekveneerimiseks.
18. Mille jaoks kasutatakse järgmise põlvkonna (Sangeri
meetod on siin esimene põlvkond) sekveneerimist? Too
näide mõnest projektist.
Uue põlvkonna sekveneerimistehnoloogiaid on kasutatud erinevates
genoomika uurimisvaldkondades, nagu nt kogu genoomi ja
transkriptoomi sekveneerimine, transkriptsioonifaktorite
seondumissaitide avastamine, mittekodeeriva RNA