Keskkonna poliitika probleemülesanne suur-konnakotkas
ohuks on hübridiseerimine. Toidu nimel konkurents toimub merikotka, väike- konnakotka
ja hiireviu vahel, kahest viimasest linnust on suur-konnakotkas väiksem ning
eelisolukorras. Peamiseks looduslikuks vaenlaseks on metsnugis, kes sööb linnu mune ning
murrab poeg, kuid selle ohuteguri mõju on veel teadmata (Keskkonnaministeerium. s.a.).
2.8 Hübridiseerimine
Hübridiseerimine toimub väike- konnakotka vahel. Suur- konnakotkapaarid on asendunud
segapaaridega ning järglased on sigimisvõimelised ja konkureerivad suur- konnakotkaga.
Kindlasti tuleks kaitsta ka segapaare, kuna: segapaarid hõlmavad suure osa suur-
konnakotka populatsioonist, segapaarid on enamjaolt tekkinud endiste suur-konnakotkaste
pesitsusaladel ja Eestis on registreeritud segapaaride taastumist „puhta“ suur-
konnakotkaste pesapaikadele. Hübriidsete konnakotkaste arvukus kasvab suur- konnakotka
annaabi.ee 
