Rakutuum
Mitteviiruslikud
retrotransposoonid on varieeruva pikkusega, LTR puuduvad, täispikk koopia sisaldab
pöördtranskriptaasi geeni. Näiteks maisi retrotransposoon Mu (mutator) paljuneb nii
kiiresti, et genoom muteerub ~50 korda sagedamini kui ilma selle retrotransposoonita
genoom. Kõik seni uuritud eukarüoodid sisaldavad retrotransposone. Imetajates peamiselt
mitteviiruslikud, pärmides ja Drosophila peamiselt viiruslikud.
~45% inimese genoomist koosneb retrotransposoonidest. Esineb ~60000 koopiat LINE (ingl
long interspersed nuclear element) tüüpi L1, moodustab ~15% genoomist. LINE-d on pikad
(~5000bp) DNA järjestused mis kujutavad endast RNA polümeraas II poolt tekkinud mRNA
pöördtranskribeeritud molekule. Seega on ilma introniteta ja promootoriteta ja seetõttu need
geenid ei ekspresseeru = pseudogeenid ja elemendid ei liigu. Mõnedel on säilunud
liikumisvõime (kodeerivad funktsionaalse pöördtranskriptaasi ja/või integraasi) ja