valkude puhastamise ja fraktsioneerimise jälgimiseks. Denaturatsiooniks kasutatav detergent SDS lagundab natiivseid valke, lõhkudes valkudel nii sekundaar- ja tertsiaarstruktuuri kui ka kvarternaarstruktuuri. Polüpeptiidide omavaheline kovalentne seondumine vähendab valguproovi analüüsi täpsust, kuna sama molekulmassiga bändid võivad sisaldada ühte polüpeptiidi või dimeeri/terrameeri. Taolise probleemi ärahoidmiseks kasutatakse proovi ettevalmistamise käigus redutseerivat agenti dithiothreitol (DTT või Clealand`i reagent) või 2-merkaptoetanooli (2-ME). Redutseerivates tingimustes lagunevad disulfiidsidemed ning disulfiidseotud valkude oligomeerid algunevad. „Plaat” geeli vorm koosneb kahest paralleelsest klaasplaadist või plastiklehest, mille vahele on asetatud tihendid (spacerid) vahemiku tekitamiseks ning geeli äravoolu takistamiseks servadest. SDS-PAGE elektroforeesi puhul kasutatakse kihilist kahe geeli kombinatsiooni. Esmalt
o Endogeense sünteesiga (ei sünteesi vaid LA ja ALA) - Toimub maksas ja lakteerivas piimanäärmes - Tsükliline protsess - 2-süsinikuline fragment sisestatakse ahelasse iga tsükli ajal - De novo süntees pole B-OX pöördprotsess kuna o Toimub tsütoplasmas o Protsessi viib läbi ekstramitokondriaalne süntaas o Lähteühend on atsetüül-CoA, ja süntees toimub läbi võtmeühendi MALONÜÜL-CoA o Vajab redutseerivat energiat (NADPH) ning ATP, bikarbonaati, biotiini, Mn o On intensiivne süsivesikuterikka toidu tarbimisjärgselt, st teda soodustab INS o Sünteesi aktiveerib tsitraat (kuna see on TKT esiprodukt palju aktiveerib sünteesi) ja pärsib atsetüül-CoA o Osaleb multiensüümne süsteem rasvhappe süntaas FAS - De novo süntees on palmitaadi süntees, mis toimub tsütoplasmas - Süntees vajab atsetüül-CoA
12 ATP: 3) 3 NADH reosüdeerub, andes 3 NAD = 9 ATP 4) 1 FADH2 annab 1 FAD = 2 ATP 4 5) GTP arvel tekib otse TKT tasemel 1 ATP Glükoosimolekuli täieliku lõhustumise saagis on 38 ATP-d. 38. Pentoosfosfaadi tsükkel ja selle bioloogiline tähtsus Glükoosi anaeroobse oksüdatsiooni rada, mille ülesandeks on toota rakufunktsioonideks vajalikke biomolekule (või nende eelühendeid) ja luua redutseerivat energiat (NADPH) Tätsus: · hõlmab 15-30 % maksa, piimanäärmete, neerupealiste, seemnesarjade, rasvkoe, erütrotsüütide totaalsest glükoosi metabolismist · toodab peaaegu poole NADPH-st, mida kasutatakse rasvhapete, steroidide, aminohapete biosünteesis, fagotsütoosis ja ksenobiootikumide detoksikatsiooniks · tootab riboos-5-P, mida vajab nukleotiidsete koensüümide (NAD, NADP, FAD) ja nukleotiidide biosüntees
Mikrobioloogia I 2017 Elu algus Maal • Elu arenes Maal mitte-elusast (elutust) materjalist. Tänapäeval elu enam nii tekkida ei saa, sest tingimused on praegu Maal hoopis teistsugused (temperatuur, gaaside koostis atmosfääris, kiirgus jne). Väga oluline on see, et elu tekke alguses ei olnud hapnikku, mis oleks kahjustanud moodustunud orgaanilisi molekule. Ürgne atmosfäär Maal oli redutseeriv, mis soodustas biomolekulide sünteesi. Kui tänapäeval on vaja tekitada redutseerivat atmosfääri, siis eemaldatakse hapnik ja asendatakse see näiteks Tingimused ürgsel lämmastikuga. Keemilised elemendid elusaines (C,H,N,O,P,S) Maal: • väga vähe hapnikku, • redutseerivad tingimused • CH4 , CO2 , N2 , NH3, jäljed CO ja H2-st, • kõrge temperatuur, • valgus, vulkaaniline tegevus, meteoriitide rünnakud Mikrobioloogia ja I 2017 Üks hüpotees elu tekkest Maal: esimesed
toimub pidev süntees ja lõhustamine. Rasvhapete biosüntees on kompleksne protsess, milles võib diferentseerida 3 põhilist etappi: glütseriini ja kõrgmolekulaarsete rasvhapete moodustumine ning nendest vastavate estrite süntees. Rasvhapete de novo süntees toimub maksas ja lakteerivas piimanäärmes tsütoplasmas ja aktiivne ekstramitokondriaalne rasvhappe süntaas viib läbi kogu sünteesi. Lähteühendiks on atsetüül-CoA. Rasvhapete süntees vajab redutseerivat (NADPH) energiat, ATP, bikarbonaati, biotiini ja mangaani. Sünteesi aktiveerib tsitraat ja pärsib atsüül-CoA. Ta prevaleerib süsivesikuterikka toidu tarbimisjärgselt ja teda soodustab kõrge insuliin/glükagoon. U 90% rasvkoe kaalust moodustavad triglütseriidid (TG). TG süntees toimub maksas, peensoole limaskestas, rasvkoes, piimanäärmes jt kudedes. Adipotsüütides olevad TG'de tilgad (rasv) on võimas energiavaru. Adipotsüütides tilkadena olevad TG on tugevalt
Üle vajaduse saadud toidusüsivesikud konserveeritakse rasvhapeteks ja salvestatakse rasvkoe triglütseriididena. Rasvkoe rasv pole staatiline varu. Toimub pidev süntees ja lõhustamine. Rasvhappe de novo süntees (lihtsamatest eelühenditest toimuv rasvhappe uuesti süntees) toimub maksas ja lakteerivas piimanäärmes. Ei ole B-OX pöördprotsess. Toimub tsütoplasmas ja aktiivne ekstramitokondoriaalne rasvhappe süntaas viib läbi kogu sünteesi. Lähteühend on atsüül-CoA. Vajab redutseerivat energiat (NADPH), ATP. Prevaleerib süsivesikuterikka toidu tarbimisjärgselt ja teda soodustab kõrge insuliin/glükagoon. Ketoosid on monosahhariidid, mis sisaldavad ketorühma (RC(=O)R'). Ketooside hulka kuulub fruktoos ehk puuviljasuhkur. 45. Steroidide ja fosfolipiidide ainevahetus Steroidid on lipiidide üks alarühm, mille hulka kuuluvad ka steroolid, milledest tuntuim on kolesterool. Fosfolipiidide baasalkohol on glütserool
valgusünteesiks ja DNA replikatsiooniks kulub 2% koguenergiast. Rakkudes energia talletamiseks ning metabolismiradade vahel liikumiseks kasutatakse peamiselt kolme molekuli: adenosiinfosfaadid (ATP/ADP/AMP), nikotiin-amiid-adeniin-dinukleotiid (NAD/NADH) ja nikotiin-amiid-adeniin- dinukleotiid-fosfaat (NADP/NADPH). ATP toob energiat substraatselt fosforüülimiselt ja membraanselt fosforüülimiselt anabolismiradadele, NADH toob redutseerivat ,,jõudu" katabolismirajalt hingamisahelale või fermenteerimise substraatidele, NADPH toob redutseerivat ,,jõudu" katabolismirajalt pentoosfosfaadirajale, NADP-sõltuvalt isotsitraadidehüdrogenaasilt või energiat nõudvalt transhüdrogenaasilt anabolismile. NAD-i ja NADP puhul on rakkudes pigem oluline nende ühendite laeng kui absoluutne kontsentratsioon, ensüümid on väga tundlikud laengu muutustele. Kataboolne redutseeriv jõud: /( ++) Anaboolne redutseeriv jõud: /( ++)