mobiilne "kaas" Trioosfosfaadi isomeraas His 95 ja Glu 165 üldine happe-aluse katalüüs Vajalik katalüütiliste gruppide täpne orienteeritus insenergeneetiliselt muudetud valk Glu165Asp (eemaldus 0,1 nm võrra), on 1000 korda väiksema aktiivsusega 11 ah jäägi (166 176) pikkuse "kaane" eemaldamisel langeb aktiivsus 105 korda lekib eenediool vaheühendit (tekib mürgine metüülglüoksaal) Trioosfosfaadi isomeraas Lihtsaim reaktsiooniskeem: Vabaenergia reaktsiooni teel Seriin proteaasid Katalüüsivad peptiidsideme hüdrolüüsi valkudes Suur grupp ensüüme kuhu kuuluvad ka seedensüümid trüpsiin ja kümotrüpsiin Kõigil seriin proteaasidel on evolutsioonis konserveerunud: · katalüütiliselt oluline seriinijääk · katalüütiline triaad Asp-His-Ser Kümotrüpsiini katalüütiline triaad Asp 102, His 57 ja Ser 195 Seriin proteaasid erinevad substraadi spetsiifilisuse poolest
Ensüümkineetika Michaelis-Menteni võrrand Minimaalne ehk lihtsaim ensüümkatalüüsitava reaktsiooni skeem on kaheastmeline reaktsiooniskeem: 1. Seostumine ensüümi E ja substraadi S vahelise kompleksi ehk ensüüm substraat kompleksi ES moodustumine (pöörduv) 2. Keemiline etapp produkti P moodustumine ensüüm substraat kompleksist (pöördumatu) ja ensüümi vabanemine Produkti moodustumise kiirus V on antud seosega: V = d[P]/dt = k2[ES] Küsimus kuidas sõltub produkti moodustumise kiirus substraadi kontsentratsioonist [S] antud ensüümi kontsentratsioonil [E]t ?
Ookeaniline maakoor. Keskmised kivimid (SiO2 52-65%) Kirjud ja aluselistega sarnased. Subduktsioonivööndites. Happelised kivimid (SiO2 65-80%) Ränist üleküllastunud. Heledad ja veidi punakad. Sisaldab kvartsi. Graniit. Mandriline maakoor. Mineraalide kristalliseerumine magmast. Mineraalid kristalliseeruvad siis kui magma üleküllastub kristalle moodustavatest elementidest. Temp ja rõhu alanemisel magma üleküllastub järjest enam ja polümeriseerub kristallideks. Boweni reaktsiooniskeem happeliste magmakivimite kristalliseerumisest. Plagioklasside puhul võib sujuvalt erineda kaltsiumi naatriumi vahekord. Kiiresti jahtuvatel kristallidel võib esineda kihilist keemilise koostise erinevust. Fe,Mg mineraalidel esineb katkendlik kristallisatsioonirida. Mingitel temperatuuridel toimub kristalliseerumine, edasisel jahtumisel see lõppeb ja mingil madalamal temperatuuril hakkab kristalliseeruma teine mineraal.
on 0,1mM või 0,1M või 0,1nM. Substraadi kontsentratsiooni varieerimise vahemiku määrab ära MM konstant, aga ülehulga asja saab määrata selle järgi, et kui palju võtame ensüümi. 0,1 mM E 0 ei rahulda ntx antud tingimust, et substraadi oleks ensüümiga võrreldes ülehulgas.) Algkiiruste mõõtmine välistab: - ensüümi denaturatsioon - produktinhibitsioon - võimalik pöördreaktsioon pH kontroll ka oluline. Kaheastmeline reaktsiooniskeem: I aste seostumine II aste keemiline aste, kus toimub substraadist produkti moodustumine EX! MM võrrand ja selle tuletamine. Seda tuleb osata teha kahel eeldusel, tulemus on erinev. 1.MM võrrandi tuletamine kiire tasakaalu eeldused 11 Produkti tekib ainult ühte noolt pidi, seetõttu saab massitoime seaduse abil kirjutada, et (reaktsioon on pöördumatu, midagi ära ei lähe, seega ei pea midagi ka maha lahutama)
sama substraadi kaks molekuli) puhul on tegemist teist järku reaktsiooniga. S1 + S2 P + Q või 2S P+Q Sel juhul on k teist järku reaktsiooni kiiruskonstant, mille dimensiooniks on mol-1 s-1. Kiiruse võrrand omab sel juhul kuju: v = k [S1]1 [S2]1 või v = k [S]2 Ensüümireaktsioone, milles osaleb üks substraat, nimetatakse monosubstraatseteks. Monosubstraatse reaktsiooni lihtsustatud reaktsiooniskeem on järgmine: k+1 k+2 E + S ES E+P k-1 Substraadi Katalüütiline sidumise staadium staadium Reaktsiooniskeemilt ilmneb, et kiiruskonstant k+1, millest sõltub ES kompleksi tekkekiirus,