Valik hakkab selliste uute mutatsioonide levikut jõulisemalt soodustama alles siis, kui nende hulk ületab teatava lävendi ning nad ei ole enam sellisel määral juhuse meelevallas. Geneetilise triiviga seotud matemaatika oleneb suuresti efektiivsest populatsioonisuurusest, kuid ei ole päris kindel, kuidas see seostub tegelikku populatsiooni moodustavate indiviidide arvuga. Aheldatus loodusliku valiku all olevate geenidega võib neutraalsetele alleelidele vähendada efektiivset populatsioonisuurust. Mida suurem on homoloogilise rekombinatsiooni sagedus, seda nõrgemaks jääb aheldatuse mõju ning koos sellega ka efektiivse populatsioonisuuruse avaldatav efekt. See efekt on nähtav molekulaarses andmestikus korrelatsioonina rekombinatsioonisageduse ja geneetilise mitmekesisuse vahel ning negatiivse korrelatsioonina geenide tiheduse ja mittekodeerivate regioonide mitmekesisuse vahel (ehk mida pikema vahemaa tagant geenid genoomis paiknevad, seda suurem on nende vahele
arvutada π. Nii same π hinnangute jaotuse millelt saame hinnata näiteks 95% usalduspiire. 3. Mida saab välja lugeda populatsiooni sisese paariviisiliste erinevuste jaotusest. Paasiviisiliste erinevuste jaotus kannab informatsiooni populatsiooni ajaloost. 4. Mis asi on asenduste sagedusspekter (Site Frecuency Spectrum) ja mida võiks järeldada kui näeme populatsioonis palju rohkem haruldasi mutatsioone kui konstantset populatsioonisuurust eeldava koalesentsi mudeli põhjal simuleeritud andmetes? Asenduste sagedusspekter on haplotüübi sagedusspekter. Kui näeme populatsioonis palju rohkem haruldasi mutatsioone kui konstantset populatsioonisuurust eeldava koalestsentsi mudel põhjal simuleeritud andmetes võib arvata, on tegemist on järsult kasvava populatsiooniga või populatsioon on tugeva valiku all. 5. Võrdle põhikomponentanalüüsi ja Fst analüüsi populatsioonide
2. Kirjelda kuidas saab simulatsioone kasutades hinnata empiirilise populatsiooni sisese geneetilise varieeruvuse (π – keskmine paariviisiline erinevus) hinnangu usalduspiire. 3. Mida saab välja lugeda populatsiooni sisese paariviisiliste erinevuste jaotusest JÜRI 4. Mis asi on asenduste sagedusspekter (Site Frecuency Spectrum) ja mida võiks järeldada kui näeme populatsioonis palju rohkem haruldasi mutatsioone kui konstantset populatsioonisuurust eeldava koalesentsi mudeli põhjal simuleeritud andmetes? Kristine Asenduste sagedusspekter ehk haplotüüpide sageduste distributsioon. See näitab sekventside hulka populatsioonis, mis esindab igat vaadeldud sekventsi alleeli (eeldusel, et individuaalid on haploidsed või homosügootsed). SFS, mida teatakse kui HFD aitab identifitseerida efektiivse populatsiooni suuruse kasvu või kahanemist kui vaadeldavad järjestused on neutraalsed.
annaabi.ee 
